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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 酶动力学参数计算，Kcat
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tzaixmc

木虫 (正式写手)

[求助] 酶动力学参数计算，Kcat 已有2人参与

最近需要计算酶动力学参数，但是对Kcat的计算有疑问。现在Vmax=0.05204 nmol/s。反应体系是100ul，浓度为0.005428 mg/ml的酶液加2ul，因此体系中酶的终浓度为(0.01085/100) mg/ml。另外可以计算加入的酶的量为0.01085 ug，酶的分子量为30520道尔顿，那么加入该体系中的酶的摩尔量为=0.01085/1000000/30520 mol=0.0003557 nmol。我觉得怎么似乎可以直接计算kcat=Vmax/[E]=0.05204 nmol/s /0.0003557 nmol=146.3 /s,这样似乎单位也可以对应起来。E指的是体系中的酶的终浓度还是摩尔质量？如果是单独的话Kcat的单位就不是 /s 了啊？还有有些帖子上说Vmax的单位是nmol/(s*mg)呢或U/mg？求高手解答
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1楼 2013-09-11 18:29:51
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hl16010921

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, 鼓励发帖交流 2013-09-14 07:04:29
1.反应速度单位是mol*L-1*s-1浓度的变化率 2.E的浓度，一般国际单位都是mol*L-1 3.用mg相关单位的都是非标准的经验算法,因为有些酶沿用了测活经验性的单位和为了简便计算使用的非公制计算单位。实际操作比较方便直观，能直接读出每毫克蛋白的催化能力。利于比较不同分子量的酶等质量情况下的酶活。（生产上有用） 4.科技文献还是都换成标准单位吧
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2楼2013-09-13 14:36:44
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tzaixmc

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hl16010921 at 2013-09-13 14:36:44
1.反应速度单位是mol*L-1*s-1浓度的变化率 2.E的浓度，一般国际单位都是mol*L-1 3.用mg相关单位的都是非标准的经验算法,因为有些酶沿用了测活经验性的单位和为了简便计算使用的非公制计算单位。实际操作比较方便直观 ...

你好，那我都换成mol*L-1*s-1或mol*L-1都是用算出来的Vmax和酶的摩尔量再除以100ul的体积吧，但是对结果没什么影响吧？
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3楼2013-09-14 12:01:28
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hl16010921

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by tzaixmc at 2013-09-14 12:01:28
你好，那我都换成mol*L-1*s-1或mol*L-1都是用算出来的Vmax和酶的摩尔量再除以100ul的体积吧，但是对结果没什么影响吧？...

应该是没影响的。Vmax变了，但Kcat不变。
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4楼2013-09-14 21:08:22
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ligangpku

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
tzaixmc: 金币+4, ★★★很有帮助, 谢谢 2015-01-26 10:08:29
（1）你应该都除以体积，但是对结果没有影响。
（2）那个帖子我也看到了，搞得很晕，发现他说错了。Vmax的单位就应该是速率单位，mol*L-1*s-1，而U/mg 应该指的是酶的比活力。
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男人，就要对自己狠一点，对别人宽容一点
5楼2015-01-24 22:18:54
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信天翁yyq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你的直接计算是对的，可以参考王镜岩生化单本，酶动力学板块，还是比较详细的。
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6楼2015-01-26 12:53:34
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