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stevenchem

金虫 (小有名气)

[求助] VMD dynamic network analysis 在windows下出现问题怎么解决?

最近想用VMD做一下动力学网络分析,我按照教程上的说明下载了相关软件包括VMD、carma、catdcd、gncommunities and subopt 等。由于catdcd没有在VMD官方网站上找到windows版本,我就在其他地方找了一个catdcd5.1。一切按照教程上的说法安装好后,我尝试在VMD的TKConsole下运行了networkSetup network.config,但是却出现了这样的错误提示
432 atoms are declared in the PSF file.
Can not open DCD file for read. Abort.
child process exited abnormally
我自己认为还是catdcd这部分出现了问题,请问有没有人出现过类似的问题,你是怎么解决的?有没有其他的可在windows下运行的catdcd版本,能不能给我发一下?还有没有其他能进行动力学网络分析的软件和方法,可不可以分享一下。多谢了!
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一山

铁杆木虫 (正式写手)

送红花一朵
楼主能共享一下catdcd5.1嘛?
忽悠王之俗家弟子
5楼2018-06-05 14:25:50
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903855173

新虫 (初入文坛)

你好,请问你现在动态网络的方法做通了吗?我目前也想做,但是是gromacs跑的结果,请问你知道如何把gromacs结果转换成psf dcd 文件吗?
2楼2014-05-01 09:14:49
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