24小时热门版块排行榜    

查看: 1239  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

stevenchem

金虫 (小有名气)

[求助] VMD dynamic network analysis 在windows下出现问题怎么解决?

最近想用VMD做一下动力学网络分析,我按照教程上的说明下载了相关软件包括VMD、carma、catdcd、gncommunities and subopt 等。由于catdcd没有在VMD官方网站上找到windows版本,我就在其他地方找了一个catdcd5.1。一切按照教程上的说法安装好后,我尝试在VMD的TKConsole下运行了networkSetup network.config,但是却出现了这样的错误提示
432 atoms are declared in the PSF file.
Can not open DCD file for read. Abort.
child process exited abnormally
我自己认为还是catdcd这部分出现了问题,请问有没有人出现过类似的问题,你是怎么解决的?有没有其他的可在windows下运行的catdcd版本,能不能给我发一下?还有没有其他能进行动力学网络分析的软件和方法,可不可以分享一下。多谢了!
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

一山

铁杆木虫 (正式写手)

送红花一朵
楼主能共享一下catdcd5.1嘛?
忽悠王之俗家弟子
5楼2018-06-05 14:25:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

903855173

新虫 (初入文坛)

你好,请问你现在动态网络的方法做通了吗?我目前也想做,但是是gromacs跑的结果,请问你知道如何把gromacs结果转换成psf dcd 文件吗?
2楼2014-05-01 09:14:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +5 薛云鹏 2026-03-13 5/250 2026-03-17 10:15 by Sammy2
[考研] 283求调剂 +3 听风就是雨; 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:41 by 热情沙漠
[基金申请] 今年的国基金是打分制吗? 50+3 zhanghaozhu 2026-03-14 3/150 2026-03-16 17:07 by 北京莱茵润色
[考研] 0703化学调剂 ,六级已过,有科研经历 +7 曦熙兮 2026-03-15 7/350 2026-03-16 16:34 by houyaoxu
[考研] 材料与化工专硕调剂 +3 heming3743 2026-03-16 3/150 2026-03-16 15:05 by peike
[考研] 一志愿华中师范071000,325求调剂 +6 RuitingC 2026-03-12 6/300 2026-03-16 14:50 by 可淡不可忘
[教师之家] 焦虑 +7 水冰月月野兔 2026-03-13 9/450 2026-03-16 10:00 by Quakerbird
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化,一志愿:哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
[考研] 求调剂(材料与化工327) +4 爱吃香菜啦 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:11 by JourneyLucky
[考研] 求材料调剂 085600英一数二总分302 前三科235 精通机器学习 一志愿哈工大 +4 林yaxin 2026-03-12 4/200 2026-03-13 22:04 by 星空星月
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[考研] 310求调剂 +3 【上上签】 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:16 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕350 求调剂 +4 王金科 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:02 by ruiyingmiao
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:30 by 求调剂zz
[考研] 0856化学工程280分求调剂 +4 shenzxsn 2026-03-11 4/200 2026-03-13 11:55 by ymwdoctor
[考研] 0856化工原理 +6 z2839474511 2026-03-10 6/300 2026-03-13 10:41 by houyaoxu
[考研] 化工学硕306求调剂 +9 42838695 2026-03-12 9/450 2026-03-13 10:16 by houyaoxu
[考研] 调剂 +5 呵唔哦豁 2026-03-10 5/250 2026-03-10 22:00 by 28375m
信息提示
请填处理意见