24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1255  |  回复: 4

stevenchem

金虫 (小有名气)

[求助] VMD dynamic network analysis 在windows下出现问题怎么解决?

最近想用VMD做一下动力学网络分析,我按照教程上的说明下载了相关软件包括VMD、carma、catdcd、gncommunities and subopt 等。由于catdcd没有在VMD官方网站上找到windows版本,我就在其他地方找了一个catdcd5.1。一切按照教程上的说法安装好后,我尝试在VMD的TKConsole下运行了networkSetup network.config,但是却出现了这样的错误提示
432 atoms are declared in the PSF file.
Can not open DCD file for read. Abort.
child process exited abnormally
我自己认为还是catdcd这部分出现了问题,请问有没有人出现过类似的问题,你是怎么解决的?有没有其他的可在windows下运行的catdcd版本,能不能给我发一下?还有没有其他能进行动力学网络分析的软件和方法,可不可以分享一下。多谢了!
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

903855173

新虫 (初入文坛)

你好,请问你现在动态网络的方法做通了吗?我目前也想做,但是是gromacs跑的结果,请问你知道如何把gromacs结果转换成psf dcd 文件吗?
2楼2014-05-01 09:14:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

华理早起的虫

新虫 (小有名气)

内容已删除
以前舍不得花十分钟看war3replay,现在却可以花一下午去打dota,总觉得以前不够努力,是人在越来越堕落,直到对生活妥协。
3楼2015-03-12 11:15:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

华理早起的虫

新虫 (小有名气)

内容已删除
以前舍不得花十分钟看war3replay,现在却可以花一下午去打dota,总觉得以前不够努力,是人在越来越堕落,直到对生活妥协。
4楼2015-03-12 11:15:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

一山

铁杆木虫 (正式写手)

送红花一朵
楼主能共享一下catdcd5.1嘛?
忽悠王之俗家弟子
5楼2018-06-05 14:25:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 stevenchem 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +21 111623 2026-04-04 23/1150 2026-04-07 02:16 by BruceLiu320
[考研] 285求调剂 +12 哦呦呼o 2026-04-04 12/600 2026-04-06 23:04 by chenzhimin
[考研] 070300化学学硕311分求调剂 +12 梁富贵险中求 2026-04-04 12/600 2026-04-06 22:54 by chenzhimin
[考研] 材料科学与工程320求调剂,080500 +7 黄瓜味薯片 2026-04-06 7/350 2026-04-06 22:38 by qlm5820
[考研] 304求调剂 +10 c297914 2026-04-05 11/550 2026-04-06 19:00 by lijunpoly
[考研] 081700,311,求调剂 +16 冬十三 2026-04-04 17/850 2026-04-06 14:56 by 尚水阁主
[考研] 一志愿河北工业大学材料工程,初试344求专硕调剂 +6 15933906766 2026-04-05 6/300 2026-04-06 13:21 by 无际的草原
[考研] 292求调剂 +3 lilllllxccc 2026-04-05 4/200 2026-04-06 10:39 by 蓝云思雨
[考研] 0817化学工程与技术求调剂,一志愿中海洋319 +14 lv945 2026-04-04 14/700 2026-04-06 10:20 by 蓝云思雨
[考研] 288求调剂 一志愿哈工大 材料与化工 +13 洛神哥哥 2026-04-03 13/650 2026-04-05 17:27 by zzx2138
[考研] 环境285分,过六级,求调剂 +10 xhr12 2026-04-02 10/500 2026-04-04 21:53 by bn53987
[考研] 085601,一志愿厦大334复试被刷求调剂 +13 曾仰之 2026-04-03 15/750 2026-04-04 20:13 by dongzh2009
[考研] 调剂 +4 是可乐不是可乐 2026-04-04 4/200 2026-04-04 19:41 by 唐沐儿
[考研] 281求调剂 +10 aaawhy 2026-04-03 10/500 2026-04-03 21:42 by lbsjt
[考研] 一志愿重庆大学085404,总分314分,求调剂 +4 zf83hn 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:25 by 啵啵啵0119
[考研] 求调剂22408 288分 +5 new382 2026-04-02 5/250 2026-04-03 09:13 by 醉在风里
[考研] 283求调剂 +3 jiouuu 2026-04-02 4/200 2026-04-02 14:08 by 哒哒哒呱呱呱
[考研] 一志愿安徽大学计算机科学与技术学硕,331分求调剂 +5 蒋昌鹏qtj 2026-04-01 5/250 2026-04-02 08:10 by fxue1114
[考研] 350求调剂 +7 阿佳~ 2026-03-31 7/350 2026-04-01 16:12 by yanflower7133
[考研] 材料调剂 +11 一样YWY 2026-03-31 11/550 2026-04-01 11:35 by wangjy2002
信息提示
请填处理意见