24小时热门版块排行榜    

查看: 1242  |  回复: 4

stevenchem

金虫 (小有名气)

[求助] VMD dynamic network analysis 在windows下出现问题怎么解决?

最近想用VMD做一下动力学网络分析,我按照教程上的说明下载了相关软件包括VMD、carma、catdcd、gncommunities and subopt 等。由于catdcd没有在VMD官方网站上找到windows版本,我就在其他地方找了一个catdcd5.1。一切按照教程上的说法安装好后,我尝试在VMD的TKConsole下运行了networkSetup network.config,但是却出现了这样的错误提示
432 atoms are declared in the PSF file.
Can not open DCD file for read. Abort.
child process exited abnormally
我自己认为还是catdcd这部分出现了问题,请问有没有人出现过类似的问题,你是怎么解决的?有没有其他的可在windows下运行的catdcd版本,能不能给我发一下?还有没有其他能进行动力学网络分析的软件和方法,可不可以分享一下。多谢了!
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

903855173

新虫 (初入文坛)

你好,请问你现在动态网络的方法做通了吗?我目前也想做,但是是gromacs跑的结果,请问你知道如何把gromacs结果转换成psf dcd 文件吗?
2楼2014-05-01 09:14:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

华理早起的虫

新虫 (小有名气)

内容已删除
以前舍不得花十分钟看war3replay,现在却可以花一下午去打dota,总觉得以前不够努力,是人在越来越堕落,直到对生活妥协。
3楼2015-03-12 11:15:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

华理早起的虫

新虫 (小有名气)

内容已删除
以前舍不得花十分钟看war3replay,现在却可以花一下午去打dota,总觉得以前不够努力,是人在越来越堕落,直到对生活妥协。
4楼2015-03-12 11:15:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

一山

铁杆木虫 (正式写手)

送红花一朵
楼主能共享一下catdcd5.1嘛?
忽悠王之俗家弟子
5楼2018-06-05 14:25:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 stevenchem 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 281求调剂(0805) +3 烟汐忆海 2026-03-16 8/400 2026-03-18 00:47 by 烟汐忆海
[考研] 302求调剂 +6 呼呼呼。。。。 2026-03-17 6/300 2026-03-17 23:56 by 星空星月
[考研] 材料,纺织,生物(0856、0710),化学招生啦 +3 Eember. 2026-03-17 7/350 2026-03-17 20:20 by 花125533
[考研] 308求调剂 +4 是Lupa啊 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:12 by ruiyingmiao
[考研] 312求调剂 +4 陌宸希 2026-03-16 5/250 2026-03-17 17:09 by ruiyingmiao
[考研] 【0856】化学工程(085602)313 分,本科学科评估A类院校化学工程与工艺,诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 8/400 2026-03-17 16:57 by ruiyingmiao
[考研] 274求调剂0856材料化工 +13 z2839474511 2026-03-11 14/700 2026-03-17 16:51 by share_joy
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林,给自己招师弟中~ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[考研] 302求调剂 +4 小贾同学123 2026-03-15 8/400 2026-03-17 10:33 by 小贾同学123
[考研] 274求调剂 +5 时间点 2026-03-13 5/250 2026-03-17 07:34 by 热情沙漠
[考研] 304求调剂 +5 素年祭语 2026-03-15 5/250 2026-03-16 17:00 by 我的船我的海
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
[考研] 294求调剂 +3 Zys010410@ 2026-03-13 4/200 2026-03-15 10:59 by zhq0425
[考研] 297求调剂 +4 学海漂泊 2026-03-13 4/200 2026-03-14 11:51 by 热情沙漠
[考研] 331求调剂(0703有机化学 +5 ZY-05 2026-03-13 6/300 2026-03-14 10:51 by Jy?
[考研] 337一志愿华南理工0805材料求调剂 +7 mysdl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 22:43 by JourneyLucky
[考研] [0860]321分求调剂,ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 材料与化工085600调剂求老师收留 +9 jiaanl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 20:22 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见