| 查看: 900 | 回复: 3 | |||
[交流]
sdf从2d转成3d坐标中的bond block会发生变化吗 已有1人参与
|
|
请教问题如上，我用两种方法把sdf文件从2d转成3d后发现坐标发生变化： 第一种：把sdf文件用marvin打开加氢以后转成3d的 第三种：直接从2d转成3d 这两种方法所得到的结果Atom block一致，但是bond blocd有所变化，不知道是什么原因，现在也不知道哪种方法是对的。 ps：第一种方法2d和3d的bond block一样，请大侠帮帮我吧，谢谢谢谢，我刚接触，了解的不多  |
回复此楼» 猜你喜欢
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有17人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有6人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
基金不中，共勉
已经有5人回复
-
看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉……
已经有3人回复
-
我不理解！
已经有23人回复
-
2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战
已经有10人回复
-
系统查不到
已经有10人回复
-
怎么查啊
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 【转帖】一些计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具
已经有109人回复
truelk
木虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 2642.7
- 散金: 20
- 红花: 1
- 帖子: 231
- 在线: 130.5小时
- 虫号: 1364487
- 注册: 2011-08-09
- 专业: 药物化学
2楼2013-08-30 21:36:02
|
你不能不参考这个网址帮我分析一下？http://en.wikipedia.org/wiki/Chemical_table_file#Molfile这里面的坐标中第三列都是0，这个是平面的意思吗？谢谢 |
3楼2013-08-31 10:27:16
truelk
木虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 2642.7
- 散金: 20
- 红花: 1
- 帖子: 231
- 在线: 130.5小时
- 虫号: 1364487
- 注册: 2011-08-09
- 专业: 药物化学
苯环本来就是平面结构啊，z坐标就应该是零 4楼2013-08-31 12:13:38
