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sdf从2d转成3d坐标中的bond block会发生变化吗已有1人参与
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请教问题如上，我用两种方法把sdf文件从2d转成3d后发现坐标发生变化： 第一种：把sdf文件用marvin打开加氢以后转成3d的 第三种：直接从2d转成3d 这两种方法所得到的结果Atom block一致，但是bond blocd有所变化，不知道是什么原因，现在也不知道哪种方法是对的。 ps：第一种方法2d和3d的bond block一样，请大侠帮帮我吧，谢谢谢谢，我刚接触，了解的不多  |
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truelk
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2楼2013-08-30 21:36:02
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你不能不参考这个网址帮我分析一下？http://en.wikipedia.org/wiki/Chemical_table_file#Molfile这里面的坐标中第三列都是0，这个是平面的意思吗？谢谢 |
3楼2013-08-31 10:27:16
truelk
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苯环本来就是平面结构啊，z坐标就应该是零4楼2013-08-31 12:13:38