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29050801

新虫 (小有名气)

[求助] 环糊精衍生物的晶体结构数据库

实验用到好多环糊精的衍生物
为了检验自己构建的衍生物的结构和真是晶体结构之间的差异
需要用到已经得到的比较权威的衍生物的结构

今天找了一下
数据库照了几个
可能没找对地方什么的
没找到
找到了几个都是给的二维的结构

不知道哪里可以找到三维的结构
在蛋白质结构里头倒是看到有相关的
但是又有以下几个顾虑
1.和蛋白质相互作用后会不会改变原有晶体结构
2.不考虑1的情况下,如果从蛋白质中分离出来。这个下载了几个试了一下,下载下载就找不到环糊精了,都是大分子,一眼望去。

[ Last edited by 29050801 on 2013-8-28 at 20:58 ]
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wsq131458

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by longytu at 2013-08-29 08:19:30
PDB数据库中有很多环糊精的结构,包括a型,b型,r型的都有,基本都是和大分子在一块!你可以把大分子删除,只保留环糊精结构

刚接触这东西,请问要怎么查?我不知道有关β-环糊精的蛋白质的ID,怎么查?谢谢
4楼2014-09-27 10:44:07
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longytu

捐助贵宾 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
29050801: 金币+2, 有帮助 2013-08-29 09:27:04
29050801: 金币+4, ★★★很有帮助 2013-10-26 09:38:58
PDB数据库中有很多环糊精的结构,包括a型,b型,r型的都有,基本都是和大分子在一块!你可以把大分子删除,只保留环糊精结构
2楼2013-08-29 08:19:30
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29050801

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by longytu at 2013-08-29 08:19:30
PDB数据库中有很多环糊精的结构,包括a型,b型,r型的都有,基本都是和大分子在一块!你可以把大分子删除,只保留环糊精结构

好的
我仔细去看以下
谢谢!
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3楼2013-08-29 09:26:52
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29050801

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wsq131458 at 2014-09-27 10:44:07
刚接触这东西,请问要怎么查?我不知道有关β-环糊精的蛋白质的ID,怎么查?谢谢...

给几个供参考
PDB查找一下几个,然后把不需要的分子删掉就剩下环糊精了

阿尔法的
2E8Z
贝塔的
1BFN
伽马的
2ZYK
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5楼2014-09-27 14:41:11
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