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whyxmc

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助--肝微粒体孵育实验

各位虫友,大家好,我最近在做肝微粒体孵育实验 但是没有反应,
我的反应体系是:肝微粒体 + 药 + NADPH + Mgcl2 + 缓冲液 → 共1ml ,
先将 肝微粒体 + 药 + Mgcl2 + 缓冲液37℃预孵育5min,NADPH 37℃预孵育5min  然后加到一块,于5、10、20、30、60、90、120min取100ul加100ul冰冷的甲醇溶液并放入-20℃冰箱中终止反应。
肝微粒体是直接买的,终浓度为1mg/ml。 NADPH四钠盐买的是罗氏的,用水配后分装小瓶,-80度冷冻,随用随拿,反应终浓度1mmol /L  。药物先取了个中间值试试,是600 umol/L,还有一个终浓度5mmol/L的Mgcl2。肝微粒体和NADPH应该都没有什么问题啊 但是却没什么反应 这是怎么回事呢 难道不该用NADPH或者是用水配不行?还是很说我的浓度有问题呢,我的缓冲液是ph7.4的磷酸钾缓冲液, 望各位虫友不吝赐教!金币奉送!

[ Last edited by 1949stone on 2013-8-27 at 07:55 ]
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whyxmc

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by yhang at 2013-08-27 16:18:07
恩,好的,我最长要孵育2h NADPH都还有活性的,半个小时如果酶活性好的话也足够代谢了~你还可以像你之前做的那样每隔一定时间取样,这样有一个时间依赖性,更能说明问题~...

以下是我最终配置,希望您能看一下有哪里不对需要改正的,小妹初学,实属菜鸟啊,忘提出宝贵意见:
1) 0.1mol/L  磷酸钾缓冲溶液(PH 7.4)
配置:1mol/L的K2HPO4  取17.418 mg双蒸水定容至100ml    取80.2ml
        1mol/L的KH2PO4  取13.609 mg双蒸水定容至100ml    取19.8ml
        二者混合后用双蒸水稀释至1000ml,调ph至7.4。
即为0.1mol/L的磷酸钾缓冲溶液  
2) 1mg/ml大鼠肝微粒体
    原装:10mg/ml    即1mg/100ul
    收到分装后立即将其放入到-80℃冰箱中,随用随拿,每次100ul
肝微粒体的复溶:放入4℃解冻,解冻后混合均匀即可,使用前保持低温储存。

3) 1mmol /L  NADPH
    原粉末25mg  分子量是833.4  用磷酸钾缓冲液配
1mmol /L = 0.8334 mg/ ml,所以将0.8334ⅹ5=4.167mg加入1ml磷酸钾缓冲液中,取200ul  即每200ul含0.8334mg,最后再使反应体系体积为1ml,即是(终浓度为1mmol /L  NADPH)
   
4) 5mmol/L  Mgcl2
5mmol/L =  20.3mg定容至100ml ,即2.03mg定容至1ml 取100ul

5) 5umol/L – 500umol/L 底物    用PH 7.4磷酸钾缓冲液配置
500 umol/L  =  51.2 mg/L  =  5.12mg/ml  即5.12mg定容1ml中取100ul
100 umol/L  =  10.24 mg/L = 1.024mg/ml   取500 umol/L的底物100ul 稀释到500ul
50 umol/L  =  5.12mg/L   取500 umol/L的底物 10ul 稀释到100ul
5 umol/L  =  0.512 mg/L  =  5.12mg/100ml  取50 umol/L的底物20ul 稀释到200ul
孵育体系为1ml  →加入100ul的肝微粒体(终浓度为1mg/ml)
               →加入200ul  5 umol/L  p-II (终浓度为5 umol/L)
                 加入100ul  50 umol/L  p-II  (终浓度为50umol/L)
                 加入500ul  100 umol/L  p-II  (终浓度为100 umol/L)
             加入100ul  500 umol/L  p-II  (终浓度为500 umol/L)
               →加入200ul的NADPH (终浓度为1mmol /L)
               →加入100ul的Mgcl2 (终浓度为5mmol/L)
依据底物浓度共分四组,最后每组都用磷酸钾缓冲液补齐到1ml
10楼2013-08-29 15:24:40
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yhang

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+5, 鼓励回帖应助! 2013-08-26 22:04:56
whyxmc: 金币+200, ★★★很有帮助, 50 2013-08-27 06:51:02
1949stone: 楼上很满意您的回答 收了人家200金 您可要帮忙帮到底啊 2013-08-27 07:54:52
要做肝微粒体实验,首先需要搞清楚该药物是经由何种酶代谢的,是I相反应的CYP酶或羧酸酯酶
,还是说II相反应的结合酶UGT酶,因为肝微粒体中主要是I相的CYP酶和羧酸酯酶和II相的UGT酶,像其他II相酶如GST等在肝微粒体中是没有的。
确定了参与药物代谢酶后才能考虑你要采用的酶源使用microsome,cytosol或是S9
药物没被代谢原因很多,你用的是底物消除还是代谢产物生成,产物生成的话是不是因为你所用的仪器灵敏度未达到所致,可以采用高灵敏度的检测仪器,如LC-MS/MS等,底物消除的话会不会是因为底物消除的太少,此时可以适当提高酶浓度试一下。
还有你底物的终浓度是600μmol/L吗?有可能是该底物浓度过高,将参与其代谢的酶的活性抑制掉了
NADPH一般是现配现用,每次称粉末,一般是用你的缓冲盐溶液溶解,不建议直接配好分装,因为冻融对其活性也会有影响~
综上,还主要是从你的检测灵敏度,药物底物浓度,NADPH配制入手,逐个排除,希望你实验早日有结果~
2楼2013-08-26 19:35:00
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whyxmc

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yhang at 2013-08-26 19:35:00
要做肝微粒体实验,首先需要搞清楚该药物是经由何种酶代谢的,是I相反应的CYP酶或羧酸酯酶
,还是说II相反应的结合酶UGT酶,因为肝微粒体中主要是I相的CYP酶和羧酸酯酶和II相的UGT酶,像其他II相酶如GST等在肝微粒 ...

感谢您的帮忙,收益良多,那么我底物浓度的终浓度是600umol,您的意思是有点大是么?那么NADPH的浓度可以么?我的检测手段是LC/MS。灵敏度这是不是可以排除?之前有人做过这个药的肝微粒体,从液相上看产生的了代谢反应,但是那个时候没有液质,所以没有检测出代谢产物的结构,我的目的就是检测代谢产物的结构!
3楼2013-08-27 06:57:35
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yhang

铁虫 (初入文坛)

★ ★ ★ ★ ★
gyesang: 金币+5, 鼓励回帖交流! 2013-08-27 17:15:11
引用回帖:
3楼: Originally posted by whyxmc at 2013-08-27 06:57:35
感谢您的帮忙,收益良多,那么我底物浓度的终浓度是600umol,您的意思是有点大是么?那么NADPH的浓度可以么?我的检测手段是LC/MS。灵敏度这是不是可以排除?之前有人做过这个药的肝微粒体,从液相上看产生的了代谢 ...

额,对的我觉得底物终浓度600μmol/L是有点太高了,因为有的药物在浓度太高时同时也会是参与其反应酶的抑制剂的,建议你降低浓度,一般在不好确定底物浓度时1μM不失为一个好的选择。
还有一个关键的问题,你的底物是用什么溶剂配的,如果是有机溶剂的话,一定注意有机溶剂在你孵育体系中的总体积不超过孵育体积的1%,也就是说你1ml的孵育体系,底物顶多加到10μl
NADPH一般终浓度1mM足够了,
灵敏度的话如果在液相上可以看到,质谱上应该灵敏度是不存在问题的
~你是没有代谢产物标准品的吗,那你要怎么确定代谢产物的MS条件呢,是直接找多余的离子碎片?
希望问题解决了可以告诉我一声~
4楼2013-08-27 10:03:35
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