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zdx516

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助:怎么看一个蛋白质的跨膜区分析(HMM的方法) 已有1人参与

我用TMHMM在线工具,分析了一个基因所编码蛋白的跨膜区分析,得到一个图,但是不知怎么分析,请各位大侠帮忙分析分析,谢谢
求助:怎么看一个蛋白质的跨膜区分析(HMM的方法)
WEBSEQUENCE.gif
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yimingwang

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-08-19 18:28:31
除了这张图应该还有一个文字说明的。你的这个蛋白应该是分泌蛋白。前段有一个Sigal peptide.具体长度看TMHMM文字说明。
Let'sdoit.
2楼2013-08-19 15:10:11
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zdx516

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yimingwang at 2013-08-19 15:10:11
除了这张图应该还有一个文字说明的。你的这个蛋白应该是分泌蛋白。前段有一个Sigal peptide.具体长度看TMHMM文字说明。

# WEBSEQUENCE Length: 333
# WEBSEQUENCE Number of predicted TMHs:  0
# WEBSEQUENCE Exp number of AAs in TMHs: 1.20513
# WEBSEQUENCE Exp number, first 60 AAs:  1.14169
# WEBSEQUENCE Total prob of N-in:        0.03836
WEBSEQUENCE        TMHMM2.0        outside             1   333

你好,这就是文字说明,谢谢
3楼2013-08-25 09:42:41
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twf0404

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zdx516 at 2013-08-25 09:42:41
# WEBSEQUENCE Length: 333
# WEBSEQUENCE Number of predicted TMHs:  0
# WEBSEQUENCE Exp number of AAs in TMHs: 1.20513
# WEBSEQUENCE Exp number, first 60 AAs:  1.14169
# WEBSEQUENCE Total prob of ...

楼主,您的问题解决了吗?我请教一下,您的这个蛋白是不存在跨膜区的吧?我的测试结果和您的差不多,新手求指教。
4楼2018-01-10 16:48:15
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小呀么萝卜

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

5楼2018-08-10 09:11:35
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