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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求助：怎么看一个蛋白质的跨膜区分析（HMM的方法）
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zdx516

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助：怎么看一个蛋白质的跨膜区分析（HMM的方法） 已有1人参与

我用TMHMM在线工具，分析了一个基因所编码蛋白的跨膜区分析，得到一个图，但是不知怎么分析，请各位大侠帮忙分析分析，谢谢
求助：怎么看一个蛋白质的跨膜区分析（HMM的方法）
WEBSEQUENCE.gif
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1楼 2013-08-19 10:04:59
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yimingwang

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-08-19 18:28:31
除了这张图应该还有一个文字说明的。你的这个蛋白应该是分泌蛋白。前段有一个Sigal peptide.具体长度看TMHMM文字说明。
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Let'sdoit.
2楼2013-08-19 15:10:11
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zdx516

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yimingwang at 2013-08-19 15:10:11
除了这张图应该还有一个文字说明的。你的这个蛋白应该是分泌蛋白。前段有一个Sigal peptide.具体长度看TMHMM文字说明。

# WEBSEQUENCE Length: 333
# WEBSEQUENCE Number of predicted TMHs:  0
# WEBSEQUENCE Exp number of AAs in TMHs: 1.20513
# WEBSEQUENCE Exp number, first 60 AAs:  1.14169
# WEBSEQUENCE Total prob of N-in:        0.03836
WEBSEQUENCE        TMHMM2.0        outside             1   333

你好，这就是文字说明，谢谢
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3楼2013-08-25 09:42:41
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twf0404

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zdx516 at 2013-08-25 09:42:41
# WEBSEQUENCE Length: 333
# WEBSEQUENCE Number of predicted TMHs:  0
# WEBSEQUENCE Exp number of AAs in TMHs: 1.20513
# WEBSEQUENCE Exp number, first 60 AAs:  1.14169
# WEBSEQUENCE Total prob of ...

楼主，您的问题解决了吗？我请教一下，您的这个蛋白是不存在跨膜区的吧？我的测试结果和您的差不多，新手求指教。
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4楼2018-01-10 16:48:15
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小呀么萝卜

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
5楼2018-08-10 09:11:35
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