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lzlgcdc

金虫 (正式写手)

[求助] 并行计算错误提示

用mpirun命令计算时   出现如下提示错误  不知道是什么原因引起的  
LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
FFT: planning ...(           6 )
reading WAVECAR
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 0 with PID 2523 on node djf-To-be-filled-by-O-E-M exited on signal 11 (Segmentation fault).
谢谢大侠指点
中间还有 forrtl:error(78):process killed (SIGTERM)提示

[ Last edited by lzlgcdc on 2013-8-13 at 22:13 ]
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future_wl

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lzlgcdc: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 谢谢大侠 这个管用了 这是什么情况呢 2013-08-14 11:20:18
你试试输入ulimit -s unlimited之后再运行
未来就是现在
2楼2013-08-14 08:57:18
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future_wl

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by future_wl at 2013-08-14 08:57:18
你试试输入ulimit -s unlimited之后再运行

你编译的时候参数设置的问题,你的编译参数限制了堆栈的大小,不利于并行计算,上面这个命令可以解除堆栈限制
未来就是现在
3楼2013-08-14 15:24:53
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lzlgcdc

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by future_wl at 2013-08-14 15:24:53
你编译的时候参数设置的问题,你的编译参数限制了堆栈的大小,不利于并行计算,上面这个命令可以解除堆栈限制...

谢谢大侠
4楼2013-08-14 16:04:25
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lzlgcdc

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by future_wl at 2013-08-14 08:57:18
你试试输入ulimit -s unlimited之后再运行

大侠  再使用这个命令后 对计算结果会有影响吗  如果重新编译 我需要怎样避免这个问题呢? 我最近算了个ELF  图像很奇怪  不知道是不是因为编译的问题   您能看下我的这个帖子吗 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6241923
谢谢
5楼2013-08-16 15:44:22
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future_wl

木虫 (著名写手)

编译不会对计算结果产生影响的,好像需要加一个参数,具体忘记了
ELF的计算结果应该和编译没关系,你应该更多检查下别的设置,例如赝势,结构文件等
未来就是现在
6楼2013-08-17 11:08:05
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lzlgcdc

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by future_wl at 2013-08-17 11:08:05
编译不会对计算结果产生影响的,好像需要加一个参数,具体忘记了
ELF的计算结果应该和编译没关系,你应该更多检查下别的设置,例如赝势,结构文件等

谢谢大侠
7楼2013-08-17 19:08:41
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添花郎

新虫 (正式写手)

前辈您好,最近用hse06计算能带的时候也出现了这个问题,请问您当初是怎么解决这个问题的呢
8楼2019-09-28 21:02:13
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