应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » pull 文献
51/1返回列表
查看: 575  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

memgr

铜虫 (正式写手)

[求助] pull 文献

最近在老师让模拟一下拉伸运动，但是没有给文献，我在网上搜了一下，发现gromacs中pull那部分可以做，想问一下大家有没有这类的文献，能资助一下吗，还有看了gromacs中pull的教程，但是关于里面的pull的原理部分还是不理解，大家能解释一下吗？谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2013-07-09 19:20:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
memgr: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-07-12 10:12:25
引用回帖:
3楼: Originally posted by memgr at 2013-07-10 10:04:37
谢谢。那个主题我也看了，其实我主要想问一下gromacs中pull的原理。我认为是pull过程是按照弹簧力的形式来拉的即按照公式F=kx，x是指的弹簧的形变，但是在体系中x具体指的是什么？还有与速率v的关系是怎样的？而且 ...

细看gromacs手册，如果你想非常详细的知道力是怎么算的，你可以再研究一下源程序吧。
赞一下 回复此楼
4楼2013-07-10 10:37:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
memgr: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-07-10 10:05:00
1、论坛里发帖的时候，系统一般会提示你先搜索一下类似的主题，这个你需要仔细
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5866501
2、搜索文献也是我们读研究生应该具备的技能啊，你在google 学术里搜索  “gromacs  pull  PMF”等关键词就能找到吧
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

memgr
2楼2013-07-09 20:52:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

memgr

铜虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-07-09 20:52:04
1、论坛里发帖的时候，系统一般会提示你先搜索一下类似的主题，这个你需要仔细
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5866501
2、搜索文献也是我们读研究生应该具备的技能啊，你在google 学术里搜索  “groma ...

谢谢。那个主题我也看了，其实我主要想问一下gromacs中pull的原理。我认为是pull过程是按照弹簧力的形式来拉的即按照公式F=kx，x是指的弹簧的形变，但是在体系中x具体指的是什么？还有与速率v的关系是怎样的？而且在模拟中输出的文件pullf.xvg中有两列，一列是时间，一列是力，这个力是怎么计算得到的？ 这些关系到pull的原理，所以我想问一下大家有知道的吗？或者有类似的文献或者书籍吗，想请教一下，谢谢
赞一下 回复此楼
3楼2013-07-10 10:04:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

memgr

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-07-10 10:37:11
细看gromacs手册，如果你想非常详细的知道力是怎么算的，你可以再研究一下源程序吧。...

源程序？但是我在gmx的安装包里面搜索，只搜到pull.h这个文件，这个就是gmx中算pull的源程序吗？
赞一下 回复此楼
5楼2013-07-11 10:08:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:21 by eObJPa4gWmp6
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:01 by eObJPa4gWmp6
[找工作] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 8/400 2026-09-06 17:49 by eObJPa4gWmp6
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 17:21 by eObJPa4gWmp6
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-04 8/400 2026-09-06 17:09 by eObJPa4gWmp6
[博后之家] 广西大学-广州大学招聘博士后 欢迎广大优秀人才！！！ +5 SCSIOyxguo 2026-09-03 8/400 2026-09-06 15:06 by 可爱小花朵
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 3/150 2026-09-06 13:09 by eObJPa4gWmp6
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 4/200 2026-09-06 12:49 by eObJPa4gWmp6
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 3/150 2026-09-06 12:49 by eObJPa4gWmp6
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 7/350 2026-09-06 11:20 by eObJPa4gWmp6
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题，而不是去凝练问题 +10 瞬息宇宙 2026-09-01 19/950 2026-09-06 11:15 by jiangxuan2004
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 8/400 2026-09-06 11:09 by eObJPa4gWmp6
[论文投稿] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-04 8/400 2026-09-06 11:00 by eObJPa4gWmp6
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 4/200 2026-09-06 07:20 by E1iiBLMU2XnD
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 7ZYIEW2YWn72 2026-09-04 9/450 2026-09-06 06:00 by E1iiBLMU2XnD
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +8 CRJ0Aq2FtVH0 2026-09-03 15/750 2026-09-06 05:48 by E1iiBLMU2XnD
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗？ +6 瞬息宇宙 2026-08-31 9/450 2026-09-05 13:11 by haizai99
[硕博家园] Ei源刊怎么投 +4 Fengshun9711 2026-09-04 4/200 2026-09-04 19:30 by 研途知予
[硕博家园] 哈尔滨工业大学韩晓军教授课题组招收2027年硕士推免生及博士研究生 +3 灯灯灯灯DDDD 2026-09-03 3/150 2026-09-03 21:22 by 科研皮皮猪
[基金申请] 要骂人了，新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西，结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭