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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » gromacs 中配体周围残基中的原子电荷
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qishiyy

银虫 (小有名气)

[求助] gromacs 中配体周围残基中的原子电荷

gromacs 中如何改变配体周围残基中的原子电荷？
我已经用resp拟合好了电荷值
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1楼 2013-07-09 15:49:35
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emrecoba

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
qishiyy: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2013-07-10 16:50:37
在对应力场的*.rtp文件里面改。这样在生成新的top文件的时候就可以用新的原子电荷了。
或者直接在top文件里面改也可以
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2楼2013-07-10 13:18:55
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qishiyy

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by emrecoba at 2013-07-10 13:18:55
在对应力场的*.rtp文件里面改。这样在生成新的top文件的时候就可以用新的原子电荷了。
或者直接在top文件里面改也可以

感谢你的回答，我再top文件中，对离配体最近的一个残基的电荷做了修改。
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3楼2013-07-10 16:50:12
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