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gh8207

木虫 (正式写手)


[交流] 已知连锁标记的应用?

以水稻为列,假若A材料中含有A基因,与A标记(SSR标记)紧密连锁,其扩增产物片段大小为205bp;再用A标记扩增B材料,若扩增产物大小也为205bp,能否说明B材料中也含有A基因?或不一定含有A基因?为什么?

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niucn

木虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by gh8207 at 2013-07-14 07:13:49
是的,这么说确实不一定,不过我见关于多样性分析一类的文章都说到,如果SSR的片段大小一样,就把它算为1个等位基因;另外一些专利里也说到,若特定的某个SSR标记扩增的片段大小和与申请保护的基因材料片段大小一样 ...

专利上说的可能是根据基因片段来设计的特异性引物,理论上扩增出的就是该基因或等位基因片段,如果特异性非常高的话,也可以区分不同的等位基因,或等位基因上核苷酸的差异

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9楼2013-07-14 08:07:31
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gh8207

木虫 (正式写手)


自己顶一下,
我认为应该说是有相同的基因,致于为什么,我也说不明白,等大虫来解答!
6楼2013-07-08 18:10:17
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niucn

木虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不一定吧,SSR扩增出的只是一个DNA片段,还不能称之为基因,其次,既使片段大小相同,也存在序列不同的可能性,如等位基因单个SNP的变化

[ 发自小木虫客户端 ]
7楼2013-07-12 13:08:54
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gh8207

木虫 (正式写手)


引用回帖:
7楼: Originally posted by niucn at 2013-07-12 13:08:54
不一定吧,SSR扩增出的只是一个DNA片段,还不能称之为基因,其次,既使片段大小相同,也存在序列不同的可能性,如等位基因单个SNP的变化

是的,这么说确实不一定,不过我见关于多样性分析一类的文章都说到,如果SSR的片段大小一样,就把它算为1个等位基因;另外一些专利里也说到,若特定的某个SSR标记扩增的片段大小和与申请保护的基因材料片段大小一样,也说它含有该基因。他们都是把连锁标记与基因等同了,您认为呢?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
8楼2013-07-14 07:13:49
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2013-07-14 09:10   回复  
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