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gh8207

木虫 (正式写手)

[交流] 已知连锁标记的应用？

以水稻为列，假若A材料中含有A基因，与A标记（SSR标记）紧密连锁，其扩增产物片段大小为205bp；再用A标记扩增B材料，若扩增产物大小也为205bp，能否说明B材料中也含有A基因？或不一定含有A基因？为什么？

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1楼 2013-07-08 06:55:29
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gh8207

木虫 (正式写手)
自己顶一下，
我认为应该说是有相同的基因，致于为什么，我也说不明白，等大虫来解答！
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6楼2013-07-08 18:10:17
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niucn

木虫 (小有名气)
★
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不一定吧，SSR扩增出的只是一个DNA片段，还不能称之为基因，其次，既使片段大小相同，也存在序列不同的可能性，如等位基因单个SNP的变化

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7楼2013-07-12 13:08:54
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gh8207

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by niucn at 2013-07-12 13:08:54
不一定吧，SSR扩增出的只是一个DNA片段，还不能称之为基因，其次，既使片段大小相同，也存在序列不同的可能性，如等位基因单个SNP的变化

是的，这么说确实不一定，不过我见关于多样性分析一类的文章都说到，如果SSR的片段大小一样，就把它算为1个等位基因；另外一些专利里也说到，若特定的某个SSR标记扩增的片段大小和与申请保护的基因材料片段大小一样，也说它含有该基因。他们都是把连锁标记与基因等同了，您认为呢？

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8楼2013-07-14 07:13:49
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niucn

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by gh8207 at 2013-07-14 07:13:49
是的，这么说确实不一定，不过我见关于多样性分析一类的文章都说到，如果SSR的片段大小一样，就把它算为1个等位基因；另外一些专利里也说到，若特定的某个SSR标记扩增的片段大小和与申请保护的基因材料片段大小一样 ...

专利上说的可能是根据基因片段来设计的特异性引物，理论上扩增出的就是该基因或等位基因片段，如果特异性非常高的话，也可以区分不同的等位基因，或等位基因上核苷酸的差异

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9楼2013-07-14 08:07:31
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天涯20122楼
2013-07-08 07:49   回复  
gh8207(金币+1): 谢谢参与
miaojiabing3楼
2013-07-08 07:52   回复  
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huaxiduan4楼
2013-07-08 08:11   回复  
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dyz7310135楼
2013-07-08 08:15   回复  
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蓝皮鼠798310楼
2013-07-14 09:10   回复  
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