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科学岛

铁虫 (初入文坛)

[求助] 用gaussian计算负一价离子的NBO时,输出文件中电荷显示为何为0

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科学岛

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lishijunzong at 2013-07-03 08:38:13
贴出你的输入与输出文件

输出文件中共有3处Summary of Natural Population Analysis:,前两处显示total=-1.000,但最后一处却显示total=0.不知是和原因,上网查过,加上(7/76=8)后仍然是同样的错误。简单的输入输出如下:
输入:%nproc=4     
%mem=500MB
# pbe1pbe/genecp Pop=NBORead

输出:前两处中的一处, Summary of Natural Population Analysis:                  
                                                         
                                       Natural Population
                Natural  -----------------------------------------------
    Atom  No    Charge         Core      Valence    Rydberg      Total
-----------------------------------------------------------------------
     Au    1   -0.06858     67.99088    11.06733    0.01038    79.06858
     Au    2   -0.06858     67.99088    11.06733    0.01038    79.06858
      C    3   -0.86284      1.99974     4.80188    0.06123     6.86284
=======================================================================
   * Total *   -1.00000    137.98149    26.93653    0.08198   165.00000
Summary of Natural Population Analysis:                  
                                                         
                                       Natural Population
                Natural  -----------------------------------------------
    Atom  No    Charge         Core      Valence    Rydberg      Total
-----------------------------------------------------------------------
     Au    1   -0.02329     33.99503     5.52360    0.00466    39.52329
     Au    2   -0.02329     33.99503     5.52360    0.00466    39.52329
      C    3    0.04659      0.99986     1.92479    0.02877     2.95341
=======================================================================
   * Total *    0.00000     68.98993    12.97199    0.03808    82.00000

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  • 附件 1 : reopt_reopt_Anion_Geom_31_.out
  • 2013-07-03 08:53:07, 204.33 K
  • 附件 2 : reopt_reopt_Anion_Geom_31_.gjf
  • 2013-07-03 08:53:22, 8.36 K
3楼2013-07-03 08:53:39
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查看全部 8 个回答

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
贴出你的输入与输出文件
2楼2013-07-03 08:38:13
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科学岛

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 科学岛 at 2013-07-03 08:53:39
输出文件中共有3处Summary of Natural Population Analysis:,前两处显示total=-1.000,但最后一处却显示total=0.不知是和原因,上网查过,加上(7/76=8)后仍然是同样的错误。简单的输入输出如下:
输入:%nproc ...

请大牛们指点一下啊,万分感谢!
4楼2013-07-03 10:54:56
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+3 2013-07-03 15:06:11
科学岛: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2013-07-03 19:17:15
第一遍输出的是对体系的总密度分析,所以加和为-1。第二遍是对alpha电子进行分析,第三遍是对beta电子进行分析。由于你的情况是自旋多重度为2的开壳层,所以alpha电子比beta电子多1,而NBO在计算alpha和beta部分的原子电荷都时将原子核电荷除以2,故beta电子和核电荷正好抵消了,而alpha电子比核电荷多1,故alpha的净电荷为-1。
5楼2013-07-03 14:49:27
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