应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » gaussian中NBO计算出现的问题
111/2返回列表12下一页
查看: 2278  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

萱月琪琪

金虫 (正式写手)

[求助] gaussian中NBO计算出现的问题

弱弱的问一句 gaussian NBO计算时候，不是说在gaussviewer中加入关键字pop，在linux终端输入的最后加入$nbo plot $end  会自动产生则得到FILE.31 --- FILE.41的文件的吗?  为什么的加$nbo plot $end之后会出现-bash:command not found .我查看了下log文档发现是正常结束的，使用chemcraf打轨迹文件的时候都是未找到该文件呢 。我应该怎么处理呢？我主要想找的是LUMO-HOMO  希望得到您的回复

我是在gv（pop=nbo）下生成gjf文件通过ssh上传到linux服务器下。在终端中输入的是：
[gs@localhost test]$ dos2unix GDC8.gjf
[gs@localhost test]$ g09 GDC8.gjf
$nbo plot $end
出现的是-bash:command not found


file.31--file.41 (资料显示) 我没有
File.31 AO Atomic Orbital ("the" basis set of host electronic structure system).
File.32 PNAO Pre-orthogonal* NAO
File.33 NAO Natural Atomic Orbital
File.34 PNHO Pre-orthogonal NHO
File.35 NHO Natural Hybrid Orbital
File.36 PNBO Pre-orthogonal NBO
File.37 NBO Natural Bond Orbital
File.38 PNLMO Pre-orthogonal NLMO
File.39 NLMO Natural Localized Molecular Orbital
File.40 MO Molecular Orbital (canonical; delocalized)
File.41 AO density matrix


我主要想找的是LUMO-HOMO ,我看了NBO的分析文档，但是还是找不到。谢谢帮助
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
世上无难事只怕有心人。。。。信心。。。毅力。。。努力。。。成功
1楼 2013-03-29 00:05:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

maynard

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
萱月琪琪: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 感谢您的多次解答 2013-03-29 09:44:02
$nbo plot $end不是在终端输入的，是放在gjf文件末尾的（和前面的输出文件空一行）
还有，要用pop=NBORead
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2013-03-29 09:16:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

萱月琪琪

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by maynard at 2013-03-29 09:16:42
$nbo plot $end不是在终端输入的，是放在gjf文件末尾的（和前面的输出文件空一行）
还有，要用pop=NBORead

你的意思是这个$nbo plot $end放在最最后面的，pop=NBORead也是在gv里面自己输入的是吧？
赞一下 回复此楼
世上无难事只怕有心人。。。。信心。。。毅力。。。努力。。。成功
3楼2013-03-29 09:31:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maynard

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 萱月琪琪 at 2013-03-29 09:31:57
你的意思是这个$nbo plot $end放在最最后面的，pop=NBORead也是在gv里面自己输入的是吧？...

对的，都是在输入文件gjf里，用什么编辑无所谓的……我一般vim的，或者直接在win下ultraedit，gv怎么输我还不太清楚
赞一下 回复此楼
4楼2013-03-29 09:36:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

萱月琪琪

金虫 (正式写手)
你的意思是这个$nbo plot $end放在gjf最最后面的，  pop=NBORead是在gv里面自己输入的是吧？
  gv里面的nbo类型还是选的full nbo吧，checkpoint save  选项是don'tsave吧   
NBO的基组和opt fre的基组是一样的吧？
那还用在gv里面输入scf=tight 吗？
非常感谢您的帮助，我在理解上稍微有点问题，希望见谅！
赞一下 回复此楼
世上无难事只怕有心人。。。。信心。。。毅力。。。努力。。。成功
5楼2013-03-29 09:40:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maynard

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 萱月琪琪 at 2013-03-29 09:40:59
你的意思是这个$nbo plot $end放在gjf最最后面的，  pop=NBORead是在gv里面自己输入的是吧？
  gv里面的nbo类型还是选的full nbo吧，checkpoint save  选项是don'tsave吧   
NBO的基组和opt fre的基组是一样的吧？ ...

嘛，应该是这样没错了，还出错的话再@我吧
赞一下 回复此楼
6楼2013-03-29 09:52:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

萱月琪琪

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by maynard at 2013-03-29 09:52:47
嘛，应该是这样没错了，还出错的话再@我吧...

我在gjf里面输入$nbo plot $end，$nbo plot  与上面的隔了一行顶行输入、对齐输入刚输入命令 [gs@localhost test]$ g09 GDC8.gjf
就掉了，打开log出现的提示是：Error termination via Lnk1e in /home/gs/g09/l1.exe at Fri Mar 29 10:21:22 2013.
赞一下 回复此楼
世上无难事只怕有心人。。。。信心。。。毅力。。。努力。。。成功
7楼2013-03-29 10:24:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maynard

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 萱月琪琪 at 2013-03-29 10:24:35
我在gjf里面输入$nbo plot $end，$nbo plot  与上面的隔了一行顶行输入、对齐输入刚输入命令 $ g09 GDC8.gjf
就掉了，打开log出现的提示是：Error termination via Lnk1e in /home/gs/g09/l1.exe at Fri Mar 29 1 ...

不介意的话还是把输入文件gjf传上来给我看看吧……
赞一下 回复此楼
8楼2013-03-29 10:37:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanrding

金虫 (正式写手)
# 行 加 pop=nboread 才行。
赞一下 回复此楼
华北电力大学（北京）数理学院，计算化学，凝聚态物理。欢迎合作！招硕士/博士研究生，招老师。
9楼2013-03-29 10:45:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maynard

金虫 (初入文坛)
举个简单的例子，C2H4的NBO计算
l1错误是关键词写错了，删掉多余的关键词和重复的内容吧

# B3LYP/6-311G** pop=NBORead

NBO

0 1
C                  0.66349900   -0.00000200   -0.00003800
C                 -0.66350800   -0.00000200   -0.00002100
H                  1.23443900   -0.92261900    0.00010600
H                  1.23442400    0.92262400    0.00009600
H                 -1.23439100    0.92264600    0.00008000
H                 -1.23441800   -0.92263100    0.00007000

$NBO PLOT $END
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

萱月琪琪
10楼2013-03-29 10:50:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 萱月琪琪 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 基金啊基金 +3 longfie172 2026-08-20 3/150 2026-08-21 00:04 by wuchongjun
[基金申请] 科研孤儿太难了 +14 我4大白菜 2026-08-20 15/750 2026-08-20 22:33 by 袁向阳007
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +8 大萍1987 2026-08-20 10/500 2026-08-20 21:48 by 大萍1987
[基金申请] 时间戳又变了 +12 wuchongjun 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:05 by spzhao
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +21 yaoyewhu2008 2026-08-20 22/1100 2026-08-20 17:03 by yaoyewhu2008
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+3 snowwithsea 2026-08-19 12/600 2026-08-20 15:56 by lfy8008
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +14 kkkl_v 2026-08-19 15/750 2026-08-20 08:21 by sunzitan
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低？主要原因有哪些？ +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜吗？ +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 什么时候开奖？ +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭