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萱月琪琪

金虫 (正式写手)

[求助] gaussian中NBO计算出现的问题

弱弱的问一句 gaussian NBO计算时候，不是说在gaussviewer中加入关键字pop，在linux终端输入的最后加入$nbo plot $end  会自动产生则得到FILE.31 --- FILE.41的文件的吗?  为什么的加$nbo plot $end之后会出现-bash:command not found .我查看了下log文档发现是正常结束的，使用chemcraf打轨迹文件的时候都是未找到该文件呢 。我应该怎么处理呢？我主要想找的是LUMO-HOMO  希望得到您的回复

我是在gv（pop=nbo）下生成gjf文件通过ssh上传到linux服务器下。在终端中输入的是：
[gs@localhost test]$ dos2unix GDC8.gjf
[gs@localhost test]$ g09 GDC8.gjf
$nbo plot $end
出现的是-bash:command not found


file.31--file.41 (资料显示) 我没有
File.31 AO Atomic Orbital ("the" basis set of host electronic structure system).
File.32 PNAO Pre-orthogonal* NAO
File.33 NAO Natural Atomic Orbital
File.34 PNHO Pre-orthogonal NHO
File.35 NHO Natural Hybrid Orbital
File.36 PNBO Pre-orthogonal NBO
File.37 NBO Natural Bond Orbital
File.38 PNLMO Pre-orthogonal NLMO
File.39 NLMO Natural Localized Molecular Orbital
File.40 MO Molecular Orbital (canonical; delocalized)
File.41 AO density matrix


我主要想找的是LUMO-HOMO ,我看了NBO的分析文档，但是还是找不到。谢谢帮助
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世上无难事只怕有心人。。。。信心。。。毅力。。。努力。。。成功
1楼 2013-03-29 00:05:00
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maynard

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 萱月琪琪 at 2013-03-29 09:40:59
你的意思是这个$nbo plot $end放在gjf最最后面的，  pop=NBORead是在gv里面自己输入的是吧？
  gv里面的nbo类型还是选的full nbo吧，checkpoint save  选项是don'tsave吧   
NBO的基组和opt fre的基组是一样的吧？ ...

嘛，应该是这样没错了，还出错的话再@我吧
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6楼2013-03-29 09:52:47
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maynard

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
萱月琪琪: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 感谢您的多次解答 2013-03-29 09:44:02
$nbo plot $end不是在终端输入的，是放在gjf文件末尾的（和前面的输出文件空一行）
还有，要用pop=NBORead
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2013-03-29 09:16:42
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萱月琪琪

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by maynard at 2013-03-29 09:16:42
$nbo plot $end不是在终端输入的，是放在gjf文件末尾的（和前面的输出文件空一行）
还有，要用pop=NBORead

你的意思是这个$nbo plot $end放在最最后面的，pop=NBORead也是在gv里面自己输入的是吧？
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世上无难事只怕有心人。。。。信心。。。毅力。。。努力。。。成功
3楼2013-03-29 09:31:57
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maynard

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 萱月琪琪 at 2013-03-29 09:31:57
你的意思是这个$nbo plot $end放在最最后面的，pop=NBORead也是在gv里面自己输入的是吧？...

对的，都是在输入文件gjf里，用什么编辑无所谓的……我一般vim的，或者直接在win下ultraedit，gv怎么输我还不太清楚
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4楼2013-03-29 09:36:55
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