24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 340  |  回复: 1

hkxya7

金虫 (小有名气)

[求助] 有关DGGE测序的一些疑问

各位虫友好,我在DGGE割胶回收测序上遇到一个问题,就是我拿到测序结果以后,将测序结果与NCBI数据库对比,发现其中与很多菌种的匹配度达到100%。DGGE扩增的区域是V3区域,这一区域的片段的大小是200bp左右,我想这么小的片段是不是很难反映出它的遗传信息,所以我想问一下有做过DGGE割胶回收的虫友们怎么看待这个问题,是不是我中间有什么地方理解错误了。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wubingqi

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
没有问题,200bp包含的遗产信息确实有限,而且现在提交GENBANK,200bp的也不让提交了。你可以用V3-V5区做DGGE,然后切胶回收测序,片段大笑在500-600bp之间。另外,即便是这样,你比对出的大部分结果也是不可培养细菌。
2楼2013-07-02 08:55:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hkxya7 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 282求调剂 +20 ycy1201 2026-04-01 22/1100 2026-04-04 00:42 by userper
[考研] 化学调剂求助 +6 LULONG1 2026-04-03 6/300 2026-04-03 23:13 by qzxyhcsy
[考研] 0710生物学336分求调剂 +5 kiyy 2026-04-01 5/250 2026-04-03 21:35 by kk112233
[考研] 0854求调剂 +3 assdll 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:32 by fxue1114
[考研] 309求调剂 +4 刘刘刘1231 2026-04-02 5/250 2026-04-03 12:04 by 1753564080
[考研] 330求调剂 +3 白神呜呼呼 2026-04-02 3/150 2026-04-03 10:15 by 蓝云思雨
[考研] 0703化学 +7 goldtt 2026-04-02 9/450 2026-04-03 09:36 by 蓝云思雨
[考研] 277求调剂 +3 12A3 2026-04-02 3/150 2026-04-02 21:30 by swb0218
[考研] 285求调剂 +8 AZMK 2026-04-02 11/550 2026-04-02 20:16 by yulian1987
[考研] 22408 266求调剂 +3 masss11222 2026-04-02 3/150 2026-04-02 18:11 by 笔落锦州
[考研] 283求调剂 +3 jiouuu 2026-04-02 4/200 2026-04-02 14:08 by 哒哒哒呱呱呱
[考研] 0856初试324分求调剂 +6 想上学求调 2026-04-01 6/300 2026-04-02 11:42 by 星空星月
[考研] 土木304求调剂 +6 兔突突突, 2026-03-31 7/350 2026-04-02 09:06 by coolminer
[考研] 调剂 +5 好好读书。 2026-03-28 7/350 2026-04-01 15:32 by 王亮_大连医科大
[考研] 材料调剂 +11 一样YWY 2026-03-31 11/550 2026-04-01 11:35 by wangjy2002
[考研] 086000生物与医药298调剂求助 +4 元元青青 2026-03-31 6/300 2026-04-01 11:13 by syh9288
[考研] 322求调剂 +8 三水sss 2026-04-01 8/400 2026-04-01 10:19 by 唐沐儿
[考研] 考研调剂 +9 小蜡新笔 2026-03-29 10/500 2026-03-31 19:52 by Dyhoer
[考研] 材料科学与工程求调剂 +13 深V宿舍吧 2026-03-29 13/650 2026-03-31 19:50 by Dyhoer
[考研] 材料工程085601数二英一335求调剂 +5 双马尾痞老板2 2026-03-31 5/250 2026-03-31 19:07 by Wang200018
信息提示
请填处理意见