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yida

木虫 (小有名气)

[求助] 带电体系动力学模拟 已有1人参与

MS中如何设置一个基团所带的电荷,比如一个分子中的硫酸根离子
跑动力学的话是不是不包含电离的过程?意思就是我建一个氢氧化钠在水中的盒子的话,跑动力学是不是不会产生钠离子和氢氧根离子?
考察吸附能、扩散系数的话,比如氢氧化钠在水体系中对一个表面的吸附过程,氢氧化钠完全溶于水,应该采用电离后的分子模型:氢氧根离子和钠离子,还是采用氢氧化钠分子合适?
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klaus1987

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yida: 金币+5, 有帮助, 谢谢参与 2013-07-04 15:57:10
设定某个原子的电荷很好办,你在结构图里选定一个原子,然后左下角的properties栏里面的第一行就显示了电荷,点击这里就能设置。
一个离子、基团(包含多个原子),我也不知道在ms里怎么设。
4楼2013-07-04 10:28:34
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sciencejoy

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yida: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-07-02 08:32:08
你说的对,分子动力学不模拟电离的过程,直接是离子。
2楼2013-07-01 22:46:30
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yida

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sciencejoy at 2013-07-01 22:46:30
你说的对,分子动力学不模拟电离的过程,直接是离子。

那么想问下怎么设置一个离子或者一个带电原子的电荷呢?
3楼2013-07-02 08:32:42
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huachao90

禁虫 (正式写手)

★ ★
yida: 金币+2, 有帮助 2014-03-09 16:26:35
本帖内容被屏蔽

5楼2014-03-09 12:17:03
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