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后悔无期

金虫 (小有名气)

[求助] RACE 技术

1、模板确定5`和3`后,5RACE的引物设计是与模板序列反向互补, 3RACE与模板序列相同?

2、TA克隆,平板或者菌液PCR的假阳性很高,可能存在啥原因呢?
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别回忆,因为回不去。把眼泪留给最疼你的人,把微笑留给伤你最深的人。
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后悔无期

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 涌动的泉 at 2013-07-01 17:22:38
第一个问题
3‘RACE是为了得到未知cDNA的下游部分,所以3‘RACE引物是“已知序列的一部分”,目的是于互补序列结合,在已知序列上寻找合适的片段就可以了。
而5’RACE引物虽然也是“已知序列的一部分”,但是由于 ...

THANKS!
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3楼2013-07-02 08:06:58
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涌动的泉

铜虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 回帖置顶 2013-07-01 18:48:47
amisking: 金币+5, MolEPI+1, 很到位的讲解啊 2013-07-01 18:48:57
后悔无期: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-07-02 08:07:33
第一个问题
3‘RACE是为了得到未知cDNA的下游部分,所以3‘RACE引物是“已知序列的一部分”,目的是于互补序列结合,在已知序列上寻找合适的片段就可以了。
而5’RACE引物虽然也是“已知序列的一部分”,但是由于延伸方向必须是5“--3”,所以其延伸方向和已知序列相反,目的是于自身已知序列结合,也就是说,可以在已知序列上寻找合适的片段做引物,但是写出来的是其“反向互补的序列”。

附件是我以前搜集的资料,讲得比较详细,你可以下下来看看

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  • 附件 1 : race引物.doc
  • 2013-07-01 17:22:22, 25 K

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

我们的过去,成就了如今的我们,无需悔恨
2楼2013-07-01 17:22:38
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后悔无期

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 涌动的泉 at 2013-07-01 17:22:38
第一个问题
3‘RACE是为了得到未知cDNA的下游部分,所以3‘RACE引物是“已知序列的一部分”,目的是于互补序列结合,在已知序列上寻找合适的片段就可以了。
而5’RACE引物虽然也是“已知序列的一部分”,但是由于 ...

比如说:在模板上找到的5RACE引物序列是5~ATGC..3:  那写出来的引物序列应该是5~GCAT...3   ?
别回忆,因为回不去。把眼泪留给最疼你的人,把微笑留给伤你最深的人。
4楼2013-07-02 08:12:12
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后悔无期

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 涌动的泉 at 2013-07-01 17:22:38
第一个问题
3‘RACE是为了得到未知cDNA的下游部分,所以3‘RACE引物是“已知序列的一部分”,目的是于互补序列结合,在已知序列上寻找合适的片段就可以了。
而5’RACE引物虽然也是“已知序列的一部分”,但是由于 ...

还是:5~CGTA...3 呢  ?
别回忆,因为回不去。把眼泪留给最疼你的人,把微笑留给伤你最深的人。
5楼2013-07-02 08:16:15
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