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zhouking8758

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-07-04 03:01:17
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10楼: Originally posted by doughtiness at 2013-07-03 10:05:03
哦,直接用PCR产物酶切,酶切位点就在目的基因的边缘,会不会影响酶切效率不好切啊?...

PCR产物直接酶切,是需要在引物的5‘段加上至少4个碱基的(GGGG,GCGC等),这样来保证酶能识别和剪切。
另外,在酶切过程中,不要加过量的酶,说明书中有说甘油过量是能降低酶活性的。
其实,一般的酶切效率都很高,一个小时完全足够。当然,酶切时间过长也没影响。
11楼2013-07-03 10:45:52
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖交流! 2013-07-04 03:01:29
引用回帖:
10楼: Originally posted by doughtiness at 2013-07-03 10:05:03
哦,直接用PCR产物酶切,酶切位点就在目的基因的边缘,会不会影响酶切效率不好切啊?...

一般有加保护碱基。酶切位点在末端的确会在一定程度上影响酶切效率,这还要看你用的是哪种限制酶。这些是设计带酶切位点的引物时要考虑的问题。
12楼2013-07-03 23:09:30
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f853012205

铁虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
用PMD19 simple  那个载体没有酶切位点  我现在也想把我的目的基因连接到载体上,然后再切下来(我的也是pPICZαA 连接不得基因  可就是连不上  我做一个月了)
13楼2013-07-05 10:42:27
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doughtiness

新虫 (小有名气)

引用回帖:
13楼: Originally posted by f853012205 at 2013-07-05 10:42:27
用PMD19 simple  那个载体没有酶切位点  我现在也想把我的目的基因连接到载体上,然后再切下来(我的也是pPICZαA 连接不得基因  可就是连不上  我做一个月了)

我做快两个月了
14楼2013-07-06 15:55:36
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doughtiness

新虫 (小有名气)

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12楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-07-03 23:09:30
一般有加保护碱基。酶切位点在末端的确会在一定程度上影响酶切效率,这还要看你用的是哪种限制酶。这些是设计带酶切位点的引物时要考虑的问题。...

我设计引物时酶切位点加了两个保护碱基,是不是加太少了啊?
15楼2013-07-06 15:59:41
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doughtiness

新虫 (小有名气)

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12楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-07-03 23:09:30
一般有加保护碱基。酶切位点在末端的确会在一定程度上影响酶切效率,这还要看你用的是哪种限制酶。这些是设计带酶切位点的引物时要考虑的问题。...

我用的是Kpnl 和 Xbal
16楼2013-07-06 16:00:07
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doughtiness

新虫 (小有名气)

引用回帖:
11楼: Originally posted by zhouking8758 at 2013-07-03 10:45:52
PCR产物直接酶切,是需要在引物的5‘段加上至少4个碱基的(GGGG,GCGC等),这样来保证酶能识别和剪切。
另外,在酶切过程中,不要加过量的酶,说明书中有说甘油过量是能降低酶活性的。
其实,一般的酶切效率都很 ...

可惜我的引物都已经设计好了,5‘端只有两个碱基,呜呜……这样PCR产物胶回收完,直接酶切会效果不佳吗?酶切时间长达7个小时也不可以吗?
17楼2013-07-06 16:01:47
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zhouking8758

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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17楼: Originally posted by doughtiness at 2013-07-06 16:01:47
可惜我的引物都已经设计好了,5‘端只有两个碱基,呜呜……这样PCR产物胶回收完,直接酶切会效果不佳吗?酶切时间长达7个小时也不可以吗?...

这个我没有试过。不过应该会影响酶的结合的。
楼主可以经过TA克隆测序后再酶切也一样的啊。
18楼2013-07-06 23:45:58
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
16楼: Originally posted by doughtiness at 2013-07-06 16:00:07
我用的是Kpnl 和 Xbal...

你的运气不错,这两个酶在5'加两个保护碱基的切割率超过90%。
19楼2013-07-07 01:17:43
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
15楼: Originally posted by doughtiness at 2013-07-06 15:59:41
我设计引物时酶切位点加了两个保护碱基,是不是加太少了啊?...

一般是要多加几个的,不过你选的这两个酶可以只加两个。
20楼2013-07-07 01:18:42
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