24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 1654  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

klaus1987

铜虫 (小有名气)

[求助] multiwfn里的哪些功能可以对NBO生成的.xx文件使用?

请问一下multiwfn里的哪些功能可以对NBO生成的.xx文件使用?

上次问电子密度的事,后来发现-3(选择分子片段)功能使用后,0功能显示的轨道会变得非常奇怪。因此不敢自己随便做了,想先系统地了解下哪些功能适用,谢谢!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


那篇文章我以前看过,他只是臆测而已,我并不完全赞同其观点。NPA电荷高估离子性这是没错的。

所谓的正交尾巴是针对单个NAO或NBO而言的,直接做轨道等值面图,把isovalue调小了就能直接看到,你也可以选择做平面图或曲线图来更精确地研究。
这篇文章http://hi.baidu.com/sobereva/item/7569d7abae9e6a258819d37e 最后一幅图的左下角那张子图,注意看会发现有一小部分C-H NBO的等值面出现在了邻近的氧原子上,这就是所谓的正交尾巴。

如果目是为了看某个原子上所有NAO的正交尾巴的总分布,那么就在主功能26的功能6里把除了那个原子以外的其它原子上的NAO的占据数都设为0,然后做密度图,就能看到由于NAO之间的正交性要求,导致此原子的密度分布有多少漏到了临近原子上。但这只能定性地考察,而不要定量地讨论。因为之前说过的原因,基于NAO、NBO之类在Multiwfn里无法得到精确的密度(但偏离不很大)。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2013-06-29 19:51:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+5 2013-06-27 13:51:28
klaus1987: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢啦 2013-06-28 09:08:37
支持NBO plot文件的初衷只是为了观看NBO产生的各种轨道,而不是基于它们做分析。计算实空间函数根本没必要用NBO plot文件。
我不知道你打算用Multiwfn对NBO产生的轨道做哪些分析,如果计算实空间函数,除非是基于NLMO,否则只能一次考察一个轨道的贡献(比如考察某个轨道的电子密度分布),而所有轨道加和值(如总密度)是没意义的,是和实际有偏差的。
轨道成分分功能对于各种NBO产生的轨道都可以做。
2楼2013-06-27 12:55:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

klaus1987

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2013-06-27 12:55:38
支持NBO plot文件的初衷只是为了观看NBO产生的各种轨道,而不是基于它们做分析。计算实空间函数根本没必要用NBO plot文件。
我不知道你打算用Multiwfn对NBO产生的轨道做哪些分析,如果计算实空间函数,除非是基于N ...

哦,我本来是想看文献里说的orthogonality tails,分析下NPA电荷的
3楼2013-06-28 09:08:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★
gmy1990: 金币+2 2013-06-28 17:22:59
引用回帖:
3楼: Originally posted by klaus1987 at 2013-06-28 09:08:08
哦,我本来是想看文献里说的orthogonality tails,分析下NPA电荷的...

orthogonality tails画个轨道波函数图(曲线图或平面图)就能看出来,对任何NBO输出的轨道都可以

这和NPA电荷无关
4楼2013-06-28 15:23:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见