| 查看: 1806 | 回复: 7 | ||
[求助]
multiwfn里的哪些功能可以对NBO生成的.xx文件使用？
|
|
请问一下multiwfn里的哪些功能可以对NBO生成的.xx文件使用？ 上次问电子密度的事，后来发现-3(选择分子片段)功能使用后，0功能显示的轨道会变得非常奇怪。因此不敢自己随便做了，想先系统地了解下哪些功能适用，谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
CSC访学博后项目获批，外方学校暂停合作该怎么办？
已经有51人回复
-
求助各位大佬，球球了，在这科萨头
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有54人回复
-
求标准卡片Cu0.4In0.4Zn1.2S2 PDF#32-0340
已经有2人回复
-
量子点电致发光器件（QLED）：蓝光量子点（QDs）和纳米氧化锌电子传输材料
已经有0人回复
-
需要一个圆偏振光诱导化学反应，请问使用圆偏振光作为光源，应该需要哪些设备搭建
已经有0人回复
-
分子动力学模拟合作需求
已经有2人回复
-
求ENDNOTE破解软件安装包
已经有4人回复
-
河海大学 （211.双一流高校）钙钛矿光电实验室丁勇团队欢迎有志青年！
已经有3人回复
-
黑龙江省原子能研究院化学课题组招收2026级化学专业或化学相关专业硕士生
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Multiwfn读取NBO的.40文件是对应MO吗？
已经有10人回复
- 建议multiwfn开发GUI界面 文件打开什么的效率太低了
已经有10人回复
- 如何用Multiwfn软件做出P DOS?
已经有4人回复
- 使用Multiwfn绘制原子轨道图形、研究原子壳层结构及相对论效应的影响
已经有17人回复
- Multiwfn的初步学习，越详细越好。
已经有6人回复
- MultiWFN想要生成用于NBO分析的cub时不能载入.37文件
已经有3人回复
- 使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道
已经有30人回复
- 用Multiwfn、Gaussview、Molekel、VMD观看龙虾、盆景、骨盆、大脑
已经有16人回复
- 使用Multiwfn做拓扑分析以及计算孤对电子角度
已经有18人回复
- 回答一些关于Multiwfn的疑问以及未来Multiwfn的发展打算
已经有37人回复
sobereva
至尊木虫 (著名写手)
本人已永久离开小木虫
- QC强帖: 17
- 应助: 226 (大学生)
- 贵宾: 5.4
- 金币: 2180.5
- 红花: 217
- 帖子: 1241
- 在线: 366.8小时
- 虫号: 281271
- 注册: 2006-09-23
- 专业: 宇宙学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+5 2013-06-27 13:51:28
klaus1987: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢啦 2013-06-28 09:08:37
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+5 2013-06-27 13:51:28
klaus1987: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢啦 2013-06-28 09:08:37
|
支持NBO plot文件的初衷只是为了观看NBO产生的各种轨道，而不是基于它们做分析。计算实空间函数根本没必要用NBO plot文件。 我不知道你打算用Multiwfn对NBO产生的轨道做哪些分析，如果计算实空间函数，除非是基于NLMO，否则只能一次考察一个轨道的贡献（比如考察某个轨道的电子密度分布），而所有轨道加和值（如总密度）是没意义的，是和实际有偏差的。 轨道成分分功能对于各种NBO产生的轨道都可以做。 |
2楼2013-06-27 12:55:38
3楼2013-06-28 09:08:08
sobereva
至尊木虫 (著名写手)
本人已永久离开小木虫
- QC强帖: 17
- 应助: 226 (大学生)
- 贵宾: 5.4
- 金币: 2180.5
- 红花: 217
- 帖子: 1241
- 在线: 366.8小时
- 虫号: 281271
- 注册: 2006-09-23
- 专业: 宇宙学
4楼2013-06-28 15:23:19
5楼2013-06-29 16:57:31
|
有一篇文献里说NPA电荷可能因为正交尾而出错，原文如下 The NPA charges employ explicitly orthogonalized (natural) atomic orbitals, and thus solve the overlap population problem. Nevertheless, we have found the NPA analysis to yield still unphysically large charges, giving a too ionic picture of covalent bonds. Presumably, the extension of the basis functions over a much larger region of space than one atom, either due to the orthogonality tails on other atoms, or due to the diffuse character of the primitive basis functions, hampers a realistic charge analysis. The use of basis set dependent methods as a tool to analyze the atomic charges is therefore questionable. 来自Voronoi Deformation Density (VDD) Charges: Assessment of the Mulliken, Bader, Hirshfeld, Weinhold, and VDD Methods for Charge Analysis |
6楼2013-06-29 17:39:35
sobereva
至尊木虫 (著名写手)
本人已永久离开小木虫
- QC强帖: 17
- 应助: 226 (大学生)
- 贵宾: 5.4
- 金币: 2180.5
- 红花: 217
- 帖子: 1241
- 在线: 366.8小时
- 虫号: 281271
- 注册: 2006-09-23
- 专业: 宇宙学
|
那篇文章我以前看过，他只是臆测而已，我并不完全赞同其观点。NPA电荷高估离子性这是没错的。 所谓的正交尾巴是针对单个NAO或NBO而言的，直接做轨道等值面图，把isovalue调小了就能直接看到，你也可以选择做平面图或曲线图来更精确地研究。 这篇文章http://hi.baidu.com/sobereva/item/7569d7abae9e6a258819d37e 最后一幅图的左下角那张子图，注意看会发现有一小部分C-H NBO的等值面出现在了邻近的氧原子上，这就是所谓的正交尾巴。 如果目是为了看某个原子上所有NAO的正交尾巴的总分布，那么就在主功能26的功能6里把除了那个原子以外的其它原子上的NAO的占据数都设为0，然后做密度图，就能看到由于NAO之间的正交性要求，导致此原子的密度分布有多少漏到了临近原子上。但这只能定性地考察，而不要定量地讨论。因为之前说过的原因，基于NAO、NBO之类在Multiwfn里无法得到精确的密度（但偏离不很大）。 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
klaus19877楼2013-06-29 19:51:21
8楼2013-06-30 18:05:25
