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multiwfn里的哪些功能可以对NBO生成的.xx文件使用？
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请问一下multiwfn里的哪些功能可以对NBO生成的.xx文件使用？ 上次问电子密度的事，后来发现-3(选择分子片段)功能使用后，0功能显示的轨道会变得非常奇怪。因此不敢自己随便做了，想先系统地了解下哪些功能适用，谢谢！ |
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sobereva
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+5 2013-06-27 13:51:28
klaus1987: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢啦 2013-06-28 09:08:37
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klaus1987: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢啦 2013-06-28 09:08:37
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支持NBO plot文件的初衷只是为了观看NBO产生的各种轨道，而不是基于它们做分析。计算实空间函数根本没必要用NBO plot文件。 我不知道你打算用Multiwfn对NBO产生的轨道做哪些分析，如果计算实空间函数，除非是基于NLMO，否则只能一次考察一个轨道的贡献（比如考察某个轨道的电子密度分布），而所有轨道加和值（如总密度）是没意义的，是和实际有偏差的。 轨道成分分功能对于各种NBO产生的轨道都可以做。 |
2楼2013-06-27 12:55:38
3楼2013-06-28 09:08:08
sobereva
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4楼2013-06-28 15:23:19
5楼2013-06-29 16:57:31
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有一篇文献里说NPA电荷可能因为正交尾而出错，原文如下 The NPA charges employ explicitly orthogonalized (natural) atomic orbitals, and thus solve the overlap population problem. Nevertheless, we have found the NPA analysis to yield still unphysically large charges, giving a too ionic picture of covalent bonds. Presumably, the extension of the basis functions over a much larger region of space than one atom, either due to the orthogonality tails on other atoms, or due to the diffuse character of the primitive basis functions, hampers a realistic charge analysis. The use of basis set dependent methods as a tool to analyze the atomic charges is therefore questionable. 来自Voronoi Deformation Density (VDD) Charges: Assessment of the Mulliken, Bader, Hirshfeld, Weinhold, and VDD Methods for Charge Analysis |
6楼2013-06-29 17:39:35
sobereva
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那篇文章我以前看过，他只是臆测而已，我并不完全赞同其观点。NPA电荷高估离子性这是没错的。 所谓的正交尾巴是针对单个NAO或NBO而言的，直接做轨道等值面图，把isovalue调小了就能直接看到，你也可以选择做平面图或曲线图来更精确地研究。 这篇文章http://hi.baidu.com/sobereva/item/7569d7abae9e6a258819d37e 最后一幅图的左下角那张子图，注意看会发现有一小部分C-H NBO的等值面出现在了邻近的氧原子上，这就是所谓的正交尾巴。 如果目是为了看某个原子上所有NAO的正交尾巴的总分布，那么就在主功能26的功能6里把除了那个原子以外的其它原子上的NAO的占据数都设为0，然后做密度图，就能看到由于NAO之间的正交性要求，导致此原子的密度分布有多少漏到了临近原子上。但这只能定性地考察，而不要定量地讨论。因为之前说过的原因，基于NAO、NBO之类在Multiwfn里无法得到精确的密度（但偏离不很大）。 |
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klaus19877楼2013-06-29 19:51:21
8楼2013-06-30 18:05:25
