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宸琦qq

新虫 (初入文坛)

[求助] 已知蛋白质38KD,如何获得其全长基因序列?

血栓栓塞性疾病严重影响人类的健康和寿命。由血栓引起的常见疾病主要有急性心肌梗塞、脑血栓和静脉血栓塞等。目前,临床上治疗血栓栓塞性疾病的首选方法是溶栓疗法,此法具有死亡率低、费用少等优点,更适合我国国情。因此近年来人们一直热衷于研究开发新的经济、适用、有效、无毒副作用的溶栓药物。我们最近从豆豉中筛选到一株能分泌高效水解血纤维蛋白(血栓的主要成分)的酶的芽孢杆菌菌株,经SDS-PAGE鉴定,该溶栓酶的分子量约38 kD 。但至今还没有见到该菌产溶栓酶的报道,也没有该酶基因的任何资料,请详细设计一株能高产分泌型溶栓酶的基因工程菌的构建路线,内容包括目的基因的克隆、重组、表达。
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-09-11 11:49:00
引用回帖:
6楼: Originally posted by OBM2013 at 2013-09-10 20:03:40
就只知道是个蛋白,也可以把该蛋白拿去测氨基酸序列吗?...

我真的不明白你在说什么?!蛋白质可以用edaman降解法为基础的自动测序仪测序,也可以MS-MS测序(后者必须将蛋白质水解为18-25aa redues)的多肽,并且要用两种裂解方法,形成重叠肽)-----MS-MS测序费用太高,一般只测定N-末端16-20aa redues,然后到蛋白质数据库中搜索出全序列,再根据全序列的5’基因来RACE。任何新蛋白质连序列不知道的话,能够被承认吗!?
8楼2013-09-11 09:23:02
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。期待你的精彩和更详细的解答。 2013-06-17 13:57:28
先把蛋白质的氨基酸序列转变为核苷酸序列,然后:

5’-RACE,基因组文库筛选出完整基因,反向PCR,染色体步移等即可获得全基因序列。具体文献和Procotols,查分子克隆。

Molecular cloning--Laboratory manuals(2001)3rd edition(3 Volumes) Free
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5998393

获得全序列基因之后,就构建载体,对构建的载体进行检测以确保载体构建成功(可以电泳或者直接测序),导入工程细胞(电转化,氯化钙等),诱导载体上的目的基因表达,筛选表达目的基因的工程细胞(阳性克隆),大规模培养表达目的基因的工程细胞(阳性克隆),最后粉碎细胞或者分离分泌表达产物,复性和分离目的蛋白质,质检,临床前试验,临床1-3期实验。

具体文献和Procotols,查阅有关基因工程的实验手册。
2楼2013-06-17 01:41:25
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bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。期待你的精彩和更详细的解答。 2013-06-17 13:57:38
把那个38kDa的蛋白从胶上挖出来送质谱测序, 这样你会得到一部分氨基酸序列的信息. 然后参考一楼的答复, 根据这些蛋白片段序列设计引物做5' 和 3' RACE.
3楼2013-06-17 05:27:56
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许许小静

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by bullfrog325 at 2013-06-17 05:27:56
把那个38kDa的蛋白从胶上挖出来送质谱测序, 这样你会得到一部分氨基酸序列的信息. 然后参考一楼的答复, 根据这些蛋白片段序列设计引物做5' 和 3' RACE.

挖出来的这一条 要是 不能 保证 是纯的一个蛋白  做质谱 能得到 氨基酸信息吗?
4楼2013-06-18 10:30:59
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