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宸琦qq

新虫 (初入文坛)

[求助] 已知蛋白质38KD,如何获得其全长基因序列?

血栓栓塞性疾病严重影响人类的健康和寿命。由血栓引起的常见疾病主要有急性心肌梗塞、脑血栓和静脉血栓塞等。目前,临床上治疗血栓栓塞性疾病的首选方法是溶栓疗法,此法具有死亡率低、费用少等优点,更适合我国国情。因此近年来人们一直热衷于研究开发新的经济、适用、有效、无毒副作用的溶栓药物。我们最近从豆豉中筛选到一株能分泌高效水解血纤维蛋白(血栓的主要成分)的酶的芽孢杆菌菌株,经SDS-PAGE鉴定,该溶栓酶的分子量约38 kD 。但至今还没有见到该菌产溶栓酶的报道,也没有该酶基因的任何资料,请详细设计一株能高产分泌型溶栓酶的基因工程菌的构建路线,内容包括目的基因的克隆、重组、表达。
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许许小静

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by bullfrog325 at 2013-06-17 05:27:56
把那个38kDa的蛋白从胶上挖出来送质谱测序, 这样你会得到一部分氨基酸序列的信息. 然后参考一楼的答复, 根据这些蛋白片段序列设计引物做5' 和 3' RACE.

挖出来的这一条 要是 不能 保证 是纯的一个蛋白  做质谱 能得到 氨基酸信息吗?
4楼2013-06-18 10:30:59
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。期待你的精彩和更详细的解答。 2013-06-17 13:57:28
先把蛋白质的氨基酸序列转变为核苷酸序列,然后:

5’-RACE,基因组文库筛选出完整基因,反向PCR,染色体步移等即可获得全基因序列。具体文献和Procotols,查分子克隆。

Molecular cloning--Laboratory manuals(2001)3rd edition(3 Volumes) Free
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5998393

获得全序列基因之后,就构建载体,对构建的载体进行检测以确保载体构建成功(可以电泳或者直接测序),导入工程细胞(电转化,氯化钙等),诱导载体上的目的基因表达,筛选表达目的基因的工程细胞(阳性克隆),大规模培养表达目的基因的工程细胞(阳性克隆),最后粉碎细胞或者分离分泌表达产物,复性和分离目的蛋白质,质检,临床前试验,临床1-3期实验。

具体文献和Procotols,查阅有关基因工程的实验手册。
2楼2013-06-17 01:41:25
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bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。期待你的精彩和更详细的解答。 2013-06-17 13:57:38
把那个38kDa的蛋白从胶上挖出来送质谱测序, 这样你会得到一部分氨基酸序列的信息. 然后参考一楼的答复, 根据这些蛋白片段序列设计引物做5' 和 3' RACE.
3楼2013-06-17 05:27:56
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bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流! 2013-09-10 22:05:14
没有关系, 因为你已经看到单一的条带了, 就算样品里面有其他的蛋白污染也是含量很少的。 你可以从质谱峰的丰度里面判断出那些峰是属于你真正想要鉴定的蛋白。
5楼2013-06-18 16:00:55
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