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lmcyjxs金虫 (正式写手)
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[求助]
大牛来指点下啊~CDS区到底含不含内含子？看了相关的帖反而把我搞糊涂了
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各位大侠，我要崩溃了，不是说我没之前没看过帖，而是看了帖之后把我搞混了。 1 CDS区到时含不含内含子？有一个老师说不含，一个说含，我看了论坛，两种说法我都好像看过。我认为是不含的。 2 如果CDS区不含内含子，有些基因在NCBI里查到的，标题上注明是全长CDS区，但下面的注释里却显示含有很多个CDS区，基因序列也显示含有多个CDS区，如图1，难道CDS区真含有内含子才是正解？但为什么我克隆了一个基因，反转录得到的，不含内含子了，获得的基因就跟图1情况一样，终止密码子还更多，导致多个CDS区存在，怎么会这样呢？如图2 3 若在一个基因序列里，含有多个CDS区（就是在多个不同位置含终止密码子），连接到表达载体是不是指翻译其识别的第一个CDS？  1.jpg  2.jpg |
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137167741说的没错。看了VERSION JN391444.1 GI:386956632 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/JN391444.1，这是DNA序列。一般说的mRNA是剪切加工成熟的，就是其中1..283和904..2353剪切后连起来的部分，而CDS是编码区，是指扣除前后非翻译区的，就是106..283和904..1865连起来的1140bp部分，这部分从ATG开始到TGA结束，正常翻译得到379个氨基酸。与AFJ49141.1 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/386956633是可以对应起来的。楼主说有终止密码子，要是是得到的序列缺失或插入，或者不理解公布的序列信息，弄错了，甚至专业里生物偏点，基础知识掌握不够好，PCR扩增的是总基因组DNA，也是可能的。 |
20楼2013-06-20 23:54:23
laoshi0633
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2楼2013-06-14 16:27:25
laoshi0633
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3楼2013-06-14 16:31:36
lmcyjxs
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4楼2013-06-14 17:07:52
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