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lmcyjxs金虫 (正式写手)
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[求助]
大牛来指点下啊~CDS区到底含不含内含子？看了相关的帖反而把我搞糊涂了
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各位大侠，我要崩溃了，不是说我没之前没看过帖，而是看了帖之后把我搞混了。 1 CDS区到时含不含内含子？有一个老师说不含，一个说含，我看了论坛，两种说法我都好像看过。我认为是不含的。 2 如果CDS区不含内含子，有些基因在NCBI里查到的，标题上注明是全长CDS区，但下面的注释里却显示含有很多个CDS区，基因序列也显示含有多个CDS区，如图1，难道CDS区真含有内含子才是正解？但为什么我克隆了一个基因，反转录得到的，不含内含子了，获得的基因就跟图1情况一样，终止密码子还更多，导致多个CDS区存在，怎么会这样呢？如图2 3 若在一个基因序列里，含有多个CDS区（就是在多个不同位置含终止密码子），连接到表达载体是不是指翻译其识别的第一个CDS？  1.jpg  2.jpg |
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lmcyjxs: 金币+4, ★★★很有帮助, 确实有些不明白的地方，望继续多多指点~ 2013-06-15 00:37:25
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-06-16 21:01:23
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lmcyjxs: 金币+4, ★★★很有帮助, 确实有些不明白的地方，望继续多多指点~ 2013-06-15 00:37:25
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-06-16 21:01:23
第一、基础知识的确需要补一下，小小批评一下 第二、所谓cds区，就是指编码区，什么叫编码区，就是编码蛋白的区域，而你在ncbi查找到的这个序列式DNA序列，如果你的截图没有错误的话，应该是ncbi的标题有问题（四川农大的人有些马虎了啊），所以在解释里面，mRNA那一行，告诉你那个碱基到多少位碱基，给出了你mRNA范围，可见你研究的基因有两个外显子，而CDS是直接相对于RNA来说的。 第三、的确存在对于某些我们认为的终止密码子，编码了其他的氨基酸的情况，但是对于你的这个，我建议你自己看看有没有复制错碱基字母，或者你同ncbi上给出的氨基酸序列比对一下。 希望可以帮到你，试验顺利~~如有不明白，可联系~~妹子  |
6楼2013-06-14 20:52:29
7楼2013-06-15 08:25:26
【答案】应助回帖
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你可以把你自己翻译的AA序列和http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/JN391444.1给出的序列比对一下，我也确定网站上的这个序列不会出现多个终止密码子序列。 其次，如果是你自己克隆的序列，可能是测序错误，或者是克隆的错配，这样子的情况在测序中会常有~~ 在此确认，http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucl ... amp;RID=VRP0PJY2015中也没有提前出现终止密码子~~ |
17楼2013-06-16 21:35:30
18楼2013-06-16 22:41:00