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lmcyjxs

金虫 (正式写手)

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[求助] 大牛来指点下啊~CDS区到底含不含内含子？看了相关的帖反而把我搞糊涂了

各位大侠，我要崩溃了，不是说我没之前没看过帖，而是看了帖之后把我搞混了。
   1 CDS区到时含不含内含子？有一个老师说不含，一个说含，我看了论坛，两种说法我都好像看过。我认为是不含的。
   2 如果CDS区不含内含子，有些基因在NCBI里查到的，标题上注明是全长CDS区，但下面的注释里却显示含有很多个CDS区，基因序列也显示含有多个CDS区，如图1，难道CDS区真含有内含子才是正解？但为什么我克隆了一个基因，反转录得到的，不含内含子了，获得的基因就跟图1情况一样，终止密码子还更多，导致多个CDS区存在，怎么会这样呢？如图2
   3 若在一个基因序列里，含有多个CDS区（就是在多个不同位置含终止密码子），连接到表达载体是不是指翻译其识别的第一个CDS？

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思路决定出路。。。

1楼 2013-06-14 16:15:35

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lmcyjxs

金虫 (正式写手)

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引用回帖:

7楼: Originally posted by 137167741 at 2013-06-15 08:25:26
我回头比对了一下子，确实是你复制序列出问题了~~，氨基酸里面不会提前出现终止密码子~~...

我表示没有复制错~~看第一个图的链接http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/JN391444.1，当你点击右边的“Highlight Sequence Features”，系统会将CDS区高亮显示，你可以试试。。。

第二个图是我自己的克隆的基因的截图啦，我是觉得奇怪，怎么会有中间有这么多终止密码子，就算有些终止密码子可以编码，但是不能说明我克隆的基因，每个终止密码子都子编码，从而不终止翻译。。。

再来一个类似的链接http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucl ... amp;RID=VRP0PJY2015
这个链接的基因跟我克隆的基因的情况更像。。。

其实类似这样的基因还有很多，新手表示不太理解。。。只是很想知道答案，不要见怪~~~