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klaus1987

铜虫 (小有名气)

[求助] Multiwfn读取NBO的.40文件是对应MO吗?

如题,manual里说NBO的.40文件是NLMO,我听说这种轨道的性质和MO是相同的,请问这种说法是否正确?
另外,我试着做了.40的电子密度格点文件,又对同一结构(相同坐标)再次用高斯计算能量,得到MO轨道的fch文件,同样做电子密度格点。两个格点文件的质量选择相同,二者相减会得到差值,也就是说.40和MO电子密度格点不一样。这是正常的吗?
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★ ★
gkf高: 金币+3 2013-06-17 11:17:08
这些.xx文件之间也不能相互比较计算出来的总的密度或其它实空间函数

原理上说,PNAO/NAO/PNHO/NHO/PNBO/NBO/PNLMO/NLMO/MO这些不管用哪种类型轨道,实空间函数(如总密度)的计算结果都是完全一致的,所以实空间函数的计算只要用MO就行了(.fch/.molden/.wfx/.wfn作为输入文件),基于其它的轨道来计算由于结果和基于MO的完全一致,所以没必要用它们。

而之所以我提到不要用NBO程序给出的轨道来计算(NLMO除外),一方面是因为这些NBO plot文件里往往没有正确记录或者根本没记录轨道占据数;另一方面是由于以某些类型轨道为基时(如NBO),整体的密度矩阵不是对角矩阵,此时以Multiwfn目前基于MO计算密度的方式来计算NBO表达的密度结果会和实际有一定偏差。
9楼2013-06-16 18:57:29
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2013-06-13 21:05:02
klaus1987: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-06-14 09:54:20
.40是MO,.39才是NLMO(手册写错了)
NLMO和MO截然不同,前者可认为是对后者酉变换产生的定域化轨道
.40和fch里的MO应当是一样的,存在差值可能是微小的数值精度问题所致,或者什么其它地方没有完全对应上。最好直接通过在主功能0观看等值面来比较二者。
2楼2013-06-13 18:10:14
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klaus1987

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2013-06-13 18:10:14
.40是MO,.39才是NLMO(手册写错了)
NLMO和MO截然不同,前者可认为是对后者酉变换产生的定域化轨道
.40和fch里的MO应当是一样的,存在差值可能是微小的数值精度问题所致,或者什么其它地方没有完全对应上。最好直 ...

我用格点文件作差得到的差值还是比较明显的啊,待我再去重复一次比较40和MO
3楼2013-06-14 09:59:40
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klaus1987

铜虫 (小有名气)

我又详细的比对了两次计算的数据,算nbo.40和mo的原子坐标是完全一致的,格点密度都是中,结果是二者的电子密度确实完全不一样。mo的格点正值乘差别元(differential element)为161.94,而nbo.40的确是383.92。
4楼2013-06-14 10:49:50
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