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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 用软件构建重组质粒并分析其表达的情况
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lmcyjxs

金虫 (正式写手)

[交流] 用软件构建重组质粒并分析其表达的情况 已有2人参与

如题，本人在表达方面是新手，不知道大家在做表达的时候，有没有先用相关软件，将目的片段与表达载体拼接构建重组质粒，分析其是否移码，从哪里开始翻译，表达什么蛋白，蛋白性质的预测分析等问题。。。。
   望各位大侠多多交流指教！推荐一些书籍或软件之类的。。

[ Last edited by lmcyjxs on 2013-6-10 at 20:01 ]
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思路决定出路。。。
1楼 2013-06-10 19:59:52
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running113

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
同楼上建议，使用Vector NTI基本就能够满足楼主的要求了。
本人也刚开始用，真的是一款不错的软件。
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SCI我来了！！！
3楼2013-06-10 22:21:32
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lmcyjxs

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by running113 at 2013-06-10 22:21:32
同楼上建议，使用Vector NTI基本就能够满足楼主的要求了。
本人也刚开始用，真的是一款不错的软件。

谢谢！我也下载了，也学习了一下！交流一下，该软件提供的载体双链，第二条链才是跟图谱对得上的。反转录方向是逆时针的，那么，插入目的片段的时候，是不是5‘端靠近启动子边，3’端靠近终止密码子边，插入到MCS区，一般就不会移码呢？
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思路决定出路。。。
4楼2013-06-10 23:26:21
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running113

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by lmcyjxs at 2013-06-10 23:26:21
谢谢！我也下载了，也学习了一下！交流一下，该软件提供的载体双链，第二条链才是跟图谱对得上的。反转录方向是逆时针的，那么，插入目的片段的时候，是不是5‘端靠近启动子边，3’端靠近终止密码子边，插入到MCS区 ...

第一个问题：
软件中如果有楼主需要的载体可以直接用，如果没有或存在差异的话，可以自建一个。
将载体命名为自己需要的名称，方便调出使用。
这样出错的机率也不大。

第二个问题：
一般质粒都会有几个启动子，楼主可以根据需要选择。
我个人觉得楼主的想法比较靠谱（靠近5`启动子边，3`端靠近终止密码子），不过实际操作的时候不一定总能这么靠谱，还得看实际情况。

我还有个问题：不知楼主是要做表达还是复制载体？

我也是初学，共同进步哈
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SCI我来了！！！
5楼2013-06-14 11:37:55
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lmcyjxs

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by running113 at 2013-06-14 11:37:55
第一个问题：
软件中如果有楼主需要的载体可以直接用，如果没有或存在差异的话，可以自建一个。
将载体命名为自己需要的名称，方便调出使用。
这样出错的机率也不大。

第二个问题：
一般质粒都会有几个启动 ...

你好！我要做表达，想先用软件分析，以便方便插入合适的酶切位点以方便连接，又不会造成移码。。。
会不会移码主要是看自己的目的基因的全长CDS区有无移位吧？
我不知道把目的片段连接到表达载体后，表达载体是从哪里开始转录翻译的，也就不知道怎么判断是否移码。。。。

俺也是新手一个。。。
共同探讨进步啦
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思路决定出路。。。
6楼2013-06-14 15:37:32
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