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lmcyjxs

金虫 (正式写手)

[交流] 用软件构建重组质粒并分析其表达的情况 已有2人参与

如题,本人在表达方面是新手,不知道大家在做表达的时候,有没有先用相关软件,将目的片段与表达载体拼接构建重组质粒,分析其是否移码,从哪里开始翻译,表达什么蛋白,蛋白性质的预测分析等问题。。。。
   望各位大侠多多交流指教!推荐一些书籍或软件之类的。。

[ Last edited by lmcyjxs on 2013-6-10 at 20:01 ]
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思路决定出路。。。
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running113

木虫 (著名写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
同楼上建议,使用Vector NTI基本就能够满足楼主的要求了。
本人也刚开始用,真的是一款不错的软件。
SCI我来了!!!
3楼2013-06-10 22:21:32
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lmcyjxs

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by running113 at 2013-06-10 22:21:32
同楼上建议,使用Vector NTI基本就能够满足楼主的要求了。
本人也刚开始用,真的是一款不错的软件。

谢谢!我也下载了,也学习了一下!交流一下,该软件提供的载体双链,第二条链才是跟图谱对得上的。反转录方向是逆时针的,那么,插入目的片段的时候,是不是5‘端靠近启动子边,3’端靠近终止密码子边,插入到MCS区,一般就不会移码呢?
思路决定出路。。。
4楼2013-06-10 23:26:21
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running113

木虫 (著名写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by lmcyjxs at 2013-06-10 23:26:21
谢谢!我也下载了,也学习了一下!交流一下,该软件提供的载体双链,第二条链才是跟图谱对得上的。反转录方向是逆时针的,那么,插入目的片段的时候,是不是5‘端靠近启动子边,3’端靠近终止密码子边,插入到MCS区 ...

第一个问题:
软件中如果有楼主需要的载体可以直接用,如果没有或存在差异的话,可以自建一个。
将载体命名为自己需要的名称,方便调出使用。
这样出错的机率也不大。

第二个问题:
一般质粒都会有几个启动子,楼主可以根据需要选择。
我个人觉得楼主的想法比较靠谱(靠近5`启动子边,3`端靠近终止密码子),不过实际操作的时候不一定总能这么靠谱,还得看实际情况。

我还有个问题:不知楼主是要做表达还是复制载体?

我也是初学,共同进步哈
SCI我来了!!!
5楼2013-06-14 11:37:55
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lmcyjxs

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by running113 at 2013-06-14 11:37:55
第一个问题:
软件中如果有楼主需要的载体可以直接用,如果没有或存在差异的话,可以自建一个。
将载体命名为自己需要的名称,方便调出使用。
这样出错的机率也不大。

第二个问题:
一般质粒都会有几个启动 ...

你好!我要做表达,想先用软件分析,以便方便插入合适的酶切位点以方便连接,又不会造成移码。。。
会不会移码主要是看自己的目的基因的全长CDS区有无移位吧?
我不知道把目的片段连接到表达载体后,表达载体是从哪里开始转录翻译的,也就不知道怎么判断是否移码。。。。

俺也是新手一个。。。
共同探讨进步啦
思路决定出路。。。
6楼2013-06-14 15:37:32
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