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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 专业学科区 » 农林 » 农林综合 » biolog ECO计算多样性指数
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tllcu

木虫 (小有名气)

[交流] biolog ECO计算多样性指数 已有4人参与

最近打算用biolog eco板测定土壤微生物群落功能多样性，在看文献的时候遇到几个问题，想请教各位虫友。在计算多样性指数时，应该选择那个时段测定的数据，有什么原则没有？另外，在计算AWCD值时，小于对照的应该舍弃？
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1楼 2013-06-05 17:23:41
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tllcu

木虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 诺亚方舟04 at 2014-03-04 21:52:59
B i o l og和 P C R2 D GGE技术解析施肥对德惠
黑土细菌群落结构和功能的影响，这篇文献2.2.2里第一段最后一句提到了，别的还有好几篇文献里也都看到过~不这样处理的话可能就会出现负值了...

不好意思啊，看到了你给我说的那篇文献，确实是小于0.06的舍去，那你怎么处理的呢？
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11楼2014-03-05 16:36:48
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木林森secret

新虫 (小有名气)
★
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有的是在96h的时候，但是具体情况好像要根据AWCD值的变化而定；还有，在计算AWCD值时，小于对照出现负值的是要归零，我是这样计算的，不知你最后是怎么算的？
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2楼2013-11-18 08:20:39
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tllcu

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 木林森secret at 2013-11-18 08:20:39
有的是在96h的时候，但是具体情况好像要根据AWCD值的变化而定；还有，在计算AWCD值时，小于对照出现负值的是要归零，我是这样计算的，不知你最后是怎么算的？

关于选择哪个点的数据计算多样性指数，也请教过其他人，没有确切的说法，我是按照快速生长期结束点的数据来计算的，计算的时候负值是要归零的，另外，你说的根据AWCD值的变化来定是什么意思？
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3楼2013-11-22 22:20:38
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木林森secret

新虫 (小有名气)
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3楼: Originally posted by tllcu at 2013-11-22 22:20:38
关于选择哪个点的数据计算多样性指数，也请教过其他人，没有确切的说法，我是按照快速生长期结束点的数据来计算的，计算的时候负值是要归零的，另外，你说的根据AWCD值的变化来定是什么意思？...

是做出关于AWCD各个时间点的曲线，选择达到最大值的时间点，进行多样性计算，和你说的按照快速生长期结束点的数据计算，应该是一样的意思。你觉得呢？还有，你的BIOLOG—ECO测定到第几个小时啊？我只测到192h，但是后来发现它的值好像还在增，而我已经停止测定。你有没有遇到这种问题呢？你是怎么处理的？求解中。。。。。期待你的回复哦。
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4楼2013-11-26 14:54:02
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