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sp-semon

金虫 (小有名气)

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[求助] 优化结构finished，但是OUTCAR中没有信息。求助！！！！！

这是INCAR：

# Basic setup:
SYSTEM = Cp2

# Accuracy controls:
PREC = High

# Use default energy cutoff for PREC

# Electronic loop controls:
ALGO = VeryFast # VeryFast (RMM-DIIS)
EDIFF = 0.000100
NELMIN = 6
SIGMA = 0.200000 # eV

# Relaxation control:
IBRION = 1 ; SMASS = 0  # Quasi-Newton (RMM-DIIS)
NSW = 50
POTIM = 0.400000
ISIF = 2
EDIFFG = 0.000500

# Properties:
LCHARG = .TRUE.
LWAVE = .TRUE.
LELF = .TRUE.
LVTOT = .TRUE.
LVHAR = .TRUE.
LREAL = .ON.
计算正常结束，但是OUTCAR中只有这些信息：

vasp.5.2.2 15Apr09 complex
executed on          LinuxIFC date 2013.06.04  19:52:02
running on 8 nodes
distr:  one band on 1 nodes, 8 groups

--------------------------------------------------------------------------------------------------------

INCAR:
POTCAR: PAW C 31May2000
POTCAR: PAW Fe 03Mar1998
POTCAR: PAW H 06May1998
请教大虾这是那里的问题呢？
另外多个文件都是空的，如CHG，CHGCAR。CONTCAR等~~~

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1楼 2013-06-05 09:15:00

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171713294

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【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 谢谢提示 2013-06-05 16:54:07

建议你重新启动一下机器看看

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坚持，不放弃

2楼2013-06-05 09:32:26

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sp-semon

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引用回帖:

2楼: Originally posted by 171713294 at 2013-06-05 09:32:26
建议你重新启动一下机器看看

我是在网格上算的，任务交了好几次了，都是这个样子？会不会跟版本有关系呢？
多指点一下~~谢谢~~

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3楼2013-06-07 22:09:41

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sp-semon

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自己顶一下！！！拜托明白的人指点一下！！！

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4楼2013-06-08 16:25:57

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KalaShayminS

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【答案】应助回帖

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。 2013-06-10 20:12:15

把标准输出和标准错误的内容贴上来看看

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5楼2013-06-08 21:05:06

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porominix

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【答案】应助回帖

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。 2013-06-10 20:12:21

是不是输出文件存放的文件夹的名称含有中文或者空格？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

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6楼2013-06-10 15:05:06

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这是Info.out文件的内容：

Parse 1371124731106335502.xml success!
Create .job.
create .job success!
create .submit
create_dot_submit success!
Working directory is : ~/sce/workspace/8113
stage in files
find: /export/lsf/perf/license/7.0: No such file or directory
find: /export/lsf/perf/license/7.0: 没有那个文件或目录
find: /export/lsf/perf/license/7.0: No such file or directory
find: /export/lsf/perf/license/7.0: 没有那个文件或目录
find: /export/lsf/perf/license/7.0: No such file or directory
find: /export/lsf/perf/license/7.0: 没有那个文件或目录
stagein_files success!
job_sub
Job <525926> is submitted to queue <normal>.
job_sub success!
set fs job status to 17
Report to center server start......

Report success!
set fs job status to 17
set cs job status to 18
Report to center server start......

Report success!
set fs job status to 18
add stage out lock
do stagingout from hpc to fs
In 10.9.1.251:~/sce/workspace/8113, rm ~/.JSDL/1371124731106335502; rm Info.out;
find: /export/lsf/perf/license/7.0: No such file or directory
find: /export/lsf/perf/license/7.0: 没有那个文件或目录
stageout_files(delete tmp files) success!
do staginout from fs to cs

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7楼2013-06-13 12:43:14

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这是stdout文件内容：

Sender: LSF System <lsfadmin@c0111>
Subject: Job 525926: </export/home/user167/.JSDL/1371124731106335502/1371124731106335502.job> Done

Job </export/home/user167/.JSDL/1371124731106335502/1371124731106335502.job> was submitted from host <console> by user <user167> in cluster <Lenovo1800>.
Job was executed on host(s) <8*c0111>, in queue <normal>, as user <user167> in cluster <Lenovo1800>.
</export/home/user167> was used as the home directory.
</export/home/user167/sce/workspace/8113> was used as the working directory.
Started at Tue Jun  4 10:45:54 2013
Results reported at Tue Jun  4 10:46:00 2013

Your job looked like:

------------------------------------------------------------
# LSBATCH: User input
/export/home/user167/.JSDL/1371124731106335502/1371124731106335502.job
------------------------------------------------------------

Successfully completed.

Resource usage summary:

CPU time :    0.63 sec.
Max Memory :       3 MB
Max Swap :       31 MB

Max Processes  :       1
Max Threads :       1

The output (if any) follows:

running on 8 nodes
distr:  one band on 1 nodes, 8 groups
vasp.5.2.2 15Apr09 complex
POSCAR found :  3 types and  211 ions
Error reading item 'LREAL' from file INCAR.
Error code was IERR=5 ... . Found N= 4 data.
Job  /export/lsf/7.0/linux2.6-glibc2.3-x86_64/bin/intelmpi_wrapper /export/home/sce/gridapp/VASP-5.2/vasp.5.2/vasp.cli

TID HOST_NAME COMMAND_LINE          STATUS          TERMINATION_TIME
===== ========== ================  =======================  ===================
00000 c0111    /export/home/sce  Done                   06/04/2013 10:45:57
00001 c0111    /export/home/sce  Done                   06/04/2013 10:45:57
00002 c0111    /export/home/sce  Done                   06/04/2013 10:45:57
00003 c0111    /export/home/sce  Done                   06/04/2013 10:45:57
00004 c0111    /export/home/sce  Done                   06/04/2013 10:45:57
00005 c0111    /export/home/sce  Done                   06/04/2013 10:45:57
00006 c0111    /export/home/sce  Done                   06/04/2013 10:45:57
00007 c0111    /export/home/sce  Done                   06/04/2013 10:45:57
Total cpucount is:8
Total runtime is:0d0h0m6s.

PS:

Read file <stderr> for stderr output of this job.

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8楼2013-06-13 12:44:05

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stderr文件是空的。
这是job.sub的内容：

find: /export/lsf/perf/license/7.0: No such file or directory
find: /export/lsf/perf/license/7.0: 没有那个文件或目录
Job <525926> is submitted to queue <normal>.

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9楼2013-06-13 12:45:28

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5楼: Originally posted by KalaShayminS at 2013-06-08 21:05:06
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内容已经上传，麻烦看一下是哪里的问题。麻烦了~~

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10楼2013-06-13 12:46:15

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