24小时热门版块排行榜    

查看: 1008  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

vivian_qi

金虫 (正式写手)

菜鸟

[求助] sybyl中怎样还原原复合物配体药效构象

如题,怎么样还原原复合物配体药效构象并与对接构象进行比较,来判断模型的还原能力,多谢啊!不太懂麻烦讲明白点
回复此楼
。。。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

win雨

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
vivian_qi: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-06-21 20:44:38
surflex模块进行对接,然后把原分子构象设为reference molecule,对接完成后会自动计算两者的RMSD值,越小越好。如果只是比较同个分子构象的差异,可以直接在application>alignment compounds下比较
5楼2013-06-03 11:49:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

vivian_qi

金虫 (正式写手)

菜鸟

怎么没人来啊?真的很想有个专业人士来帮帮忙
。。。
2楼2013-05-31 19:48:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
vivian_qi: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢,能不能把步骤说详细些呢,菜鸟一个不知道具体怎么做 2013-06-01 11:00:06
对接后构象与实际构象,用RMSD来判断,值越小越好。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
3楼2013-06-01 07:37:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vivian_qi

金虫 (正式写手)

菜鸟

引用回帖:
3楼: Originally posted by tjegg at 2013-06-01 07:37:47
对接后构象与实际构象,用RMSD来判断,值越小越好。

谢谢,能不能把步骤说详细些呢,菜鸟一个不知道具体怎么做
。。。
4楼2013-06-01 14:35:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料工程专硕274一志愿211求调剂 +6 薛云鹏 2026-03-15 6/300 2026-03-17 11:05 by 学员h26Tkc
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +7 邱gl 2026-03-11 8/400 2026-03-17 09:36 by 努力学习赚彩礼
[考研] 278求调剂 +3 Yy7400 2026-03-13 3/150 2026-03-17 08:24 by laoshidan
[考研] 274求调剂 +5 时间点 2026-03-13 5/250 2026-03-17 07:34 by 热情沙漠
[考研] 341求调剂 +5 捣蛋猪猪 2026-03-11 5/250 2026-03-17 06:56 by Muziwl
[考研] 286求调剂 +3 lemonzzn 2026-03-16 5/250 2026-03-16 20:43 by lemonzzn
[考研] 304求调剂 +5 素年祭语 2026-03-15 5/250 2026-03-16 17:00 by 我的船我的海
[考研] 304求调剂 +4 ahbd 2026-03-14 4/200 2026-03-16 16:48 by 我的船我的海
[考研] 318求调剂 +3 Yanyali 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:41 by houyaoxu
[考研] 283求调剂 +10 小楼。 2026-03-12 14/700 2026-03-16 16:08 by 13811244083
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
[考研] 【0703化学调剂】-一志愿华中师范大学-六级475 +5 Becho359 2026-03-11 5/250 2026-03-14 11:35 by 哦哦123
[考研] 2026考研调剂+本科延边大学+山东大学+生物化学与分子生物学+有项目经验 +3 ccdsscjy 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:12 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +5 是Lupa啊 2026-03-11 5/250 2026-03-13 22:13 by JourneyLucky
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +6 步川酷紫123 2026-03-13 6/300 2026-03-13 21:59 by 星空星月
[考研] 一志愿西南交大,材料专硕317求调剂 +5 lx8568 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:43 by peike
[论文投稿] 投稿问题 5+4 星光灿烂xt 2026-03-12 6/300 2026-03-13 14:17 by god_tian
[考研] 工科0856专硕化学工程269能调剂吗 +10 我想读研11 2026-03-10 10/500 2026-03-13 10:14 by Yuyi.
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-12 4/200 2026-03-12 19:33 by 求调剂zz
[考研] 调剂 +5 呵唔哦豁 2026-03-10 5/250 2026-03-10 22:00 by 28375m
信息提示
请填处理意见