应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 分析 » 数据分析 » 代谢组学GC/MS数据预处理
131/2返回列表12下一页
查看: 3544  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

雨后花瓣L

银虫 (小有名气)

[求助] 代谢组学GC/MS数据预处理

我是用安捷伦7890GC/MS做代谢分析，做统计分析需要将数据处理成（变量×样本）的矩阵，直接将数据导成excel格式后，变量峰很多（几千个），而且不同样本的出峰不能对齐。。。求高手们推荐解决办法
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
初心不改，方能始终
1楼 2013-05-27 16:39:22
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

yqx1985

木虫 (著名写手)

云中仙

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 雨后花瓣L at 2013-08-21 10:21:55
只看到用XCMS处理LC-MS数据的，是不是不能处理GCMS数据哦。。。而且我的数据格式是.SMS导入不进去啊，怎么办...

数据格式是SMS啊，那你先看看能不能用第三方软件把你的数据格式转换为XCMS可识别的格式，比如一些标准格式mzXML等；如果没法转化的话，你就把数据导成csv格式，然后用COW算法，把你的峰对齐，这样就能生成长度一样的矩阵了
赞一下(1人) 回复此楼
人面不知何时去，桃花依旧笑春风
8楼2013-08-26 16:01:06
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

笑盲虫

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用matlab处理吧   
或者用spss也可以
赞一下 回复此楼
用文字走路，用行动分析
2楼2013-05-27 17:19:49
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨后花瓣L

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 笑盲虫 at 2013-05-27 17:19:49
用matlab处理吧   
或者用spss也可以

现在是想要，把多个样本的总离子流色谱图的出峰时间对齐，组成一个矩阵，，，用matlab怎么做啊，要不要自己写程序呢
赞一下 回复此楼
初心不改，方能始终
3楼2013-05-28 21:25:15
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

笑盲虫

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

是的  matlab需要自己写程序的  不过你在网上搜一下，应当能搜到相应的源代码
赞一下 回复此楼
用文字走路，用行动分析
4楼2013-05-29 08:28:44
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yqx1985

木虫 (著名写手)

云中仙

【答案】应助回帖

用XCMS嘛
不行，我帮你
赞一下 回复此楼
人面不知何时去，桃花依旧笑春风
5楼2013-06-14 15:14:13
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sean男孩

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

可以考虑XCMS或METALIGH
赞一下 回复此楼
6楼2013-08-15 11:54:20
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨后花瓣L

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by yqx1985 at 2013-06-14 15:14:13
用XCMS嘛
不行，我帮你

只看到用XCMS处理LC-MS数据的，是不是不能处理GCMS数据哦。。。而且我的数据格式是.SMS导入不进去啊，怎么办
赞一下 回复此楼
初心不改，方能始终
7楼2013-08-21 10:21:55
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨后花瓣L

银虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by yqx1985 at 2013-08-26 16:01:06
数据格式是SMS啊，那你先看看能不能用第三方软件把你的数据格式转换为XCMS可识别的格式，比如一些标准格式mzXML等；如果没法转化的话，你就把数据导成csv格式，然后用COW算法，把你的峰对齐，这样就能生成长度一样 ...

matlab里面没有看到COW算法呀
赞一下 回复此楼
初心不改，方能始终
9楼2013-08-27 11:24:48
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yqx1985

木虫 (著名写手)

云中仙

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by 雨后花瓣L at 2013-08-27 11:24:48
matlab里面没有看到COW算法呀...

内事不决问百度，外事不决问谷歌啊。
下面的连接就是COW和DTW算法
http://www.models.life.ku.dk/dtw_cow
赞一下 回复此楼
人面不知何时去，桃花依旧笑春风
10楼2013-08-27 13:20:39
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 雨后花瓣L 的主题更新
131/2返回列表12下一页
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工专硕调剂 +4 heming3743 2026-03-16 4/200 2026-03-17 13:42 by houyaoxu
[考研] 268求调剂 +7 一定有学上- 2026-03-14 8/400 2026-03-17 13:10 by zz820
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +5 薛云鹏 2026-03-13 5/250 2026-03-17 10:15 by Sammy2
[考研] 考研调剂 +3 淇ya_~ 2026-03-17 5/250 2026-03-17 09:25 by Winj1e
[考研] 材料专硕326求调剂 +5 墨煜姒莘 2026-03-15 5/250 2026-03-16 21:30 by 木瓜膏
[考研] 328求调剂，英语六级551，有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-16 4/200 2026-03-16 20:13 by Wangjingyue
[考研] 一志愿211 0703方向310分求调剂 +3 努力奋斗112 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:44 by houyaoxu
[考研] 321求调剂 +5 大米饭！ 2026-03-15 5/250 2026-03-16 16:33 by houyaoxu
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:58 by 漾漾123sun
[考研] 材料与化工求调剂 +3 为学666 2026-03-16 3/150 2026-03-16 15:09 by 加号+
[考研] 一志愿华中师范071000，325求调剂 +6 RuitingC 2026-03-12 6/300 2026-03-16 14:50 by 可淡不可忘
[教师之家] 焦虑 +7 水冰月月野兔 2026-03-13 9/450 2026-03-16 10:00 by Quakerbird
[考研] 315求调剂 +9 小羊小羊_ 2026-03-11 10/500 2026-03-13 21:13 by SXNU李老师
[考研] 301求调剂 +6 Liyouyumairs 2026-03-11 6/300 2026-03-13 20:11 by JourneyLucky
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 求调剂 +7 18880831720 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:10 by JourneyLucky
[考研] 307求调剂 +5 超级伊昂大王 2026-03-12 5/250 2026-03-13 15:56 by 棒棒球手
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂！ +3 不想理你 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:18 by JourneyLucky
[考研] 26考研求调剂 +5 丶宏Sir 2026-03-13 5/250 2026-03-13 13:05 by JourneyLucky
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭