应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 分析 » 数据分析 » 代谢组学GC/MS数据预处理
131/2返回列表12下一页
查看: 3566  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

雨后花瓣L

银虫 (小有名气)

[求助] 代谢组学GC/MS数据预处理

我是用安捷伦7890GC/MS做代谢分析，做统计分析需要将数据处理成（变量×样本）的矩阵，直接将数据导成excel格式后，变量峰很多（几千个），而且不同样本的出峰不能对齐。。。求高手们推荐解决办法
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
初心不改，方能始终
1楼 2013-05-27 16:39:22
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

yqx1985

木虫 (著名写手)

云中仙

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 雨后花瓣L at 2013-08-21 10:21:55
只看到用XCMS处理LC-MS数据的，是不是不能处理GCMS数据哦。。。而且我的数据格式是.SMS导入不进去啊，怎么办...

数据格式是SMS啊，那你先看看能不能用第三方软件把你的数据格式转换为XCMS可识别的格式，比如一些标准格式mzXML等；如果没法转化的话，你就把数据导成csv格式，然后用COW算法，把你的峰对齐，这样就能生成长度一样的矩阵了
赞一下(1人) 回复此楼
人面不知何时去，桃花依旧笑春风
8楼2013-08-26 16:01:06
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

笑盲虫

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用matlab处理吧   
或者用spss也可以
赞一下 回复此楼
用文字走路，用行动分析
2楼2013-05-27 17:19:49
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨后花瓣L

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 笑盲虫 at 2013-05-27 17:19:49
用matlab处理吧   
或者用spss也可以

现在是想要，把多个样本的总离子流色谱图的出峰时间对齐，组成一个矩阵，，，用matlab怎么做啊，要不要自己写程序呢
赞一下 回复此楼
初心不改，方能始终
3楼2013-05-28 21:25:15
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

笑盲虫

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

是的  matlab需要自己写程序的  不过你在网上搜一下，应当能搜到相应的源代码
赞一下 回复此楼
用文字走路，用行动分析
4楼2013-05-29 08:28:44
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yqx1985

木虫 (著名写手)

云中仙

【答案】应助回帖

用XCMS嘛
不行，我帮你
赞一下 回复此楼
人面不知何时去，桃花依旧笑春风
5楼2013-06-14 15:14:13
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sean男孩

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

可以考虑XCMS或METALIGH
赞一下 回复此楼
6楼2013-08-15 11:54:20
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨后花瓣L

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by yqx1985 at 2013-06-14 15:14:13
用XCMS嘛
不行，我帮你

只看到用XCMS处理LC-MS数据的，是不是不能处理GCMS数据哦。。。而且我的数据格式是.SMS导入不进去啊，怎么办
赞一下 回复此楼
初心不改，方能始终
7楼2013-08-21 10:21:55
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨后花瓣L

银虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by yqx1985 at 2013-08-26 16:01:06
数据格式是SMS啊，那你先看看能不能用第三方软件把你的数据格式转换为XCMS可识别的格式，比如一些标准格式mzXML等；如果没法转化的话，你就把数据导成csv格式，然后用COW算法，把你的峰对齐，这样就能生成长度一样 ...

matlab里面没有看到COW算法呀
赞一下 回复此楼
初心不改，方能始终
9楼2013-08-27 11:24:48
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yqx1985

木虫 (著名写手)

云中仙

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by 雨后花瓣L at 2013-08-27 11:24:48
matlab里面没有看到COW算法呀...

内事不决问百度，外事不决问谷歌啊。
下面的连接就是COW和DTW算法
http://www.models.life.ku.dk/dtw_cow
赞一下 回复此楼
人面不知何时去，桃花依旧笑春风
10楼2013-08-27 13:20:39
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 雨后花瓣L 的主题更新
131/2返回列表12下一页
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 279分求调剂 一志愿211 +11 chaojifeixia 2026-03-19 12/600 2026-03-21 01:49 by 星空星月
[考研] 280求调剂 +7 咕噜晓晓 2026-03-18 8/400 2026-03-21 01:27 by JourneyLucky
[考研] 【考研调剂】化学专业 281分，一志愿四川大学，诚心求调剂 +8 吃吃吃才有意义 2026-03-19 8/400 2026-03-21 00:49 by 刘国森
[考研] 296求调剂 +6 www_q 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:56 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +3 阿姐阿姐家啊 2026-03-18 3/150 2026-03-20 23:24 by JourneyLucky
[考研] 一志愿苏州大学材料求调剂，总分315（英一） +5 sbdksD 2026-03-19 5/250 2026-03-20 22:10 by luoyongfeng
[考研] A区线材料学调剂 +5 周周无极 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:33 by laoshidan
[考研] 一志愿西安交通大学 学硕 354求调剂 +3 我想要读研究生 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:13 by JourneyLucky
[考研] 281求调剂（0805） +14 烟汐忆海 2026-03-16 25/1250 2026-03-20 15:47 by yuncha
[考研] 081700化工学硕调剂 +3 【1】 2026-03-16 3/150 2026-03-19 23:40 by edmund7
[考研] 生物学调剂招人！！！ +3 山海天岚 2026-03-17 4/200 2026-03-19 21:34 by 怎么释怀
[考研] 一志愿西安交通大学材料工程专业 282分求调剂 +5 枫桥ZL 2026-03-18 7/350 2026-03-19 14:52 by 功夫疯狂
[考研] 277调剂 +5 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-17 19:26 by 李leezz
[考研] 326求调剂 +5 上岸的小葡 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:26 by ruiyingmiao
[硕博家园] 湖北工业大学 生命科学与健康学院-课题组招收2026级食品/生物方向硕士 +3 1喜春8 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:18 by ber川cool子
[考研] 一志愿，福州大学材料专硕339分求调剂 +3 木子momo青争 2026-03-15 3/150 2026-03-17 07:52 by laoshidan
[考研] 283求调剂 +3 听风就是雨； 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:41 by 热情沙漠
[考研] 东南大学364求调剂 +5 JasonYuiui 2026-03-15 5/250 2026-03-16 21:28 by 木瓜膏
[考研] 0854控制工程 359求调剂 可跨专业 +3 626776879 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:42 by 626776879
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭