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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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cya_yanan

银虫 (小有名气)

[求助] 用BALST比对相似高的序列建树,为什么不在同一分支呢

如题,测序得到几个序列,BLAST后得到几个相似性很高的序列,可是建树的时候他们不在一个分支啊,怎么回事啊 ,新人啊
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137167741

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

建树之前是需要做其他的模型检验的,建树的根本是序列在进化过程中的变化,假如在一个漫长的进化过程中(可能是数百万年乃至上亿年),某一个位点的碱基由A变成G,然后再有G突变成A,而另外一个物种的的该位点始终是A,表面上着两个序列式一样的,那么他们的进化是不一样的,在建数的时候不是仅仅比较序列相似性,点一点软件这么简单,这样子建的树,可信度往往很低,建树要对序列位点选择压力验证,某些位点是正向突变,反向突变还是中性突变。此外,要进行饱和性检验,已经达到位点饱和的序列是不适合用来建进化树的,所有不是所有的序列都能拿来搞进化的。
希望可以帮到你~~
总有一天我要修改用户名。
8楼2013-11-08 18:55:56
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llvi

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 金币+1, 鼓励老虫发帖交流 2013-05-12 09:37:11
可能是你把序列弄反了,把反向的序列调整过来就好了。
2楼2013-05-12 09:06:36
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你的outgroup以及其他分支的序列选择了什么?
3楼2013-05-12 09:36:31
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cya_yanan

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by llvi at 2013-05-12 09:06:36
可能是你把序列弄反了,把反向的序列调整过来就好了。

调整过来 还是那样,呵呵 谢谢啊,好久没来了
4楼2013-05-27 16:01:08
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