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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 用BALST比对相似高的序列建树，为什么不在同一分支呢
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cya_yanan

银虫 (小有名气)

[求助] 用BALST比对相似高的序列建树，为什么不在同一分支呢

如题，测序得到几个序列，BLAST后得到几个相似性很高的序列，可是建树的时候他们不在一个分支啊，怎么回事啊 ，新人啊
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1楼 2013-05-11 19:32:20
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

序列相似度太高的话，是有可能发生这种情况。你可以考虑做个SH test，看2个不同的树结构之间有没有差异。
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6楼2013-05-28 07:39:36
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llvi

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+1, 鼓励老虫发帖交流 2013-05-12 09:37:11
可能是你把序列弄反了，把反向的序列调整过来就好了。
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2楼2013-05-12 09:06:36
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你的outgroup以及其他分支的序列选择了什么？
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2013-05-12 09:36:31
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cya_yanan

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by llvi at 2013-05-12 09:06:36
可能是你把序列弄反了，把反向的序列调整过来就好了。

调整过来 还是那样，呵呵 谢谢啊，好久没来了
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4楼2013-05-27 16:01:08
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