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llyman

银虫 (小有名气)

[求助] DIGE操作的相关问题

各位虫友大家好,本实验室目前有一个蛋白质组学实验。在考虑ITRAQ和DIGE二者之一。二者均可在当地完成实验,但是之前有一批样品(不同于本次材料)的ITRAQ结果鉴定得到的蛋白点数较少,和常规双向电泳不相上下;而DIGE又是刚刚开始在这里做,缺乏经验。因此纠结该选哪一个方案,盼虫友指教。另外期望做过其中任何一个实验的大侠能提供一下QQ联系方式,或邮件,在下可以更直接请教这两个实验的具体细节问题,谢谢大家
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景杰生物

新虫 (初入文坛)


可能是实验的操作或数据分析问题吧,或者是您的物种的数据库不全面,基因库等等,导致ITRAQ的结果搜索数据库的时候得到的蛋白不多,要不然,itraq的通量绝对是比双向大的多的多。目前主流是做ITRAQ,得到的通量可以做GO,pathway等高级生物信息学分析,建议,直接做itraq,更有意义
2楼2013-05-28 10:47:03
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llyman

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 景杰生物 at 2013-05-28 10:47:03
可能是实验的操作或数据分析问题吧,或者是您的物种的数据库不全面,基因库等等,导致ITRAQ的结果搜索数据库的时候得到的蛋白不多,要不然,itraq的通量绝对是比双向大的多的多。目前主流是做ITRAQ,得到的通量可以 ...

谢谢
3楼2013-05-28 16:09:28
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