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[交流]
怎样描述一个三维结构？
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本人对一二维结构描述还凑合，但见到三维结构就发蒙，哪位高手指点一下如何找一个类似结构比葫芦画瓢呢，比如如何在CCDC中寻找类似结构，步骤如何？举个例子说明最好 （随便回答都行嗷） [ Last edited by 小木虫2007 on 2007-9-30 at 07:29 ] |
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aczhang
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前期准备： （1）查CCDC上你这个配体已有的结构，主要看人家是怎么描述你这个配体分配位方式的。 （2）找几篇你认为写的比较清楚的描述3D结构的文献，研读一下，心里有个感觉。 动手： （1）首先描述基本结构单元unit，比如不对称单元含有XXX，原子几配位，什么构型，谁提供配位原子，键长键角范围等等 （2）描述subunit，看unit通过什么配体，以什么角度，方向等连接成什么样的subunit （3）类似描述3D结构是如何由subunit连成的。其中subunit可以有不同等级，视具体情况而定。 以上是我的一点小经验，大家多交流一下吧，文章写多了估计都会有自己顺手的模式了 |
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