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小木虫2007

[交流] 怎样描述一个三维结构?

本人对一二维结构描述还凑合,但见到三维结构就发蒙,哪位高手指点一下如何找一个类似结构比葫芦画瓢呢,比如如何在CCDC中寻找类似结构,步骤如何?举个例子说明最好
(随便回答都行嗷)

[ Last edited by 小木虫2007 on 2007-9-30 at 07:29 ]
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yt729

银虫 (小有名气)

看看别人发表的文章怎么描述类似的三维结构呀,三维结构的文章很多啊
2楼2007-09-30 09:12:59
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aczhang

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
小木虫2007(金币+3,VIP+0):谢了
lingzi326(金币+2,VIP+0):Thank you.
前期准备:
(1)查CCDC上你这个配体已有的结构,主要看人家是怎么描述你这个配体分配位方式的。
(2)找几篇你认为写的比较清楚的描述3D结构的文献,研读一下,心里有个感觉。
动手:
(1)首先描述基本结构单元unit,比如不对称单元含有XXX,原子几配位,什么构型,谁提供配位原子,键长键角范围等等
(2)描述subunit,看unit通过什么配体,以什么角度,方向等连接成什么样的subunit
(3)类似描述3D结构是如何由subunit连成的。其中subunit可以有不同等级,视具体情况而定。
以上是我的一点小经验,大家多交流一下吧,文章写多了估计都会有自己顺手的模式了
3楼2007-09-30 11:25:19
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hnthdht

至尊木虫 (职业作家)

知识青年

★ ★ ★ ★ ★
小木虫2007(金币+5,VIP+0):谢谢提醒
多看看这方面的综述文章哦!
上山下乡去旅游
4楼2007-10-01 09:19:42
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gohappy

铜虫 (正式写手)


小木虫2007(金币+1,VIP+0):谢谢
先说一维的,再说二维的,最后说三维结构。一般是按照这个顺序的,注意和基本单元和连接点就可以了
5楼2007-10-01 11:35:27
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