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[交流]
怎样描述一个三维结构?
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本人对一二维结构描述还凑合,但见到三维结构就发蒙,哪位高手指点一下如何找一个类似结构比葫芦画瓢呢,比如如何在CCDC中寻找类似结构,步骤如何?举个例子说明最好 (随便回答都行嗷) [ Last edited by 小木虫2007 on 2007-9-30 at 07:29 ] |
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2楼2007-09-30 09:12:59
aczhang
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小木虫2007(金币+3,VIP+0):谢了
lingzi326(金币+2,VIP+0):Thank you.
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前期准备: (1)查CCDC上你这个配体已有的结构,主要看人家是怎么描述你这个配体分配位方式的。 (2)找几篇你认为写的比较清楚的描述3D结构的文献,研读一下,心里有个感觉。 动手: (1)首先描述基本结构单元unit,比如不对称单元含有XXX,原子几配位,什么构型,谁提供配位原子,键长键角范围等等 (2)描述subunit,看unit通过什么配体,以什么角度,方向等连接成什么样的subunit (3)类似描述3D结构是如何由subunit连成的。其中subunit可以有不同等级,视具体情况而定。 以上是我的一点小经验,大家多交流一下吧,文章写多了估计都会有自己顺手的模式了 |
3楼2007-09-30 11:25:19
hnthdht
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4楼2007-10-01 09:19:42
gohappy
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