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lyaikele

金虫 (小有名气)

[求助] TD-PCR做出来条带很多怎么办,求高人指点

本人新手,做微藻多样性的,最近开始做PCR,跟着一篇文献里的方法做。

文献里用的是TD-PCR,程序是这样说的“10 cycles of 94° for 15s,60 to 51° for 30s,72°for 2min。Followed by 25 cycles of 94° 15s,55°for 30 to 54s and 72° for 2min and final extension of 72° 7min”,如果我没理解错的话这句话的意思是前10个循环退火温度从60逐渐降到51,每个循环降1°,后25个循环退火温度为55°,但时间从30s逐渐增加到54s,每循环增加1s。

可是P出来的结果有很多条带,目的片段为1070bp,而跑胶跑出来有2000bp左右的,有1000bp左右的,还有900多bp左右的,而且那个1000多bp的跑出来也不齐,想请教前辈们有没有碰到过这种情况的,如何解决或者该往哪方面思考问题出在哪里。

引物是按文献合成的,Tm值分别为53.1和46,PCR体系也是按文献来的,用的酶也是同一公司的。

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纯木木鱼

新虫 (初入文坛)

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7楼2013-05-09 09:30:19
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