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关于amber中 explicit solvent和implicit solvent的解释
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[交流]
关于amber中 explicit solvent和implicit solvent的解释
动力学模拟中常见到implicit solvent和explicit solvent两种情况,对这两个专业名词的中文解释一直不是太确定,各位动力学大牛给个确切的解释和定义,谢谢!
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2013-05-08 17:04:14
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2013-05-10 10:40:22
网上多的是,可以先看看这个
http://biomaps.rutgers.edu/lecture_3_1_26_2010.pdf
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2013-05-08 23:01:49
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2013-05-10 10:40:54
隐性溶剂和显性溶剂啊
后者就是添加显性水分子溶剂到体系中
前者就是把水当作连续介质,做个近似的计算
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3楼
2013-05-08 23:58:37
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gzl9901
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2013-05-09 00:52:46
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faelwong
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2013-05-12 11:30:02
隐式溶溶剂和显式溶剂,一般显式溶剂加完之后看到一个一个的水分子,动力学模拟的时候比较常用,隐式溶剂在很多商业软件的能量最小化的时候都可以看到,运算量会小很多
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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5楼
2013-05-12 09:33:59
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xikunneo1989
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
就是一个是隐含水(用GB或PB),一个是显含水。
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6楼
2014-06-09 10:42:07
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