应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » Rosetta在线预测怎么只能提交一个蛋白
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 1031  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

totoro1992

新虫 (初入文坛)

[求助] Rosetta在线预测怎么只能提交一个蛋白

用Rosetta在线预测想对接两个蛋白，只能在Combined pdb file提交一个，Docking partners, list of chains separated by underscore (like:A_B or QW_CDE)是什么意思啊》？？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

酶的资料

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-05-04 22:32:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

totoro1992

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by xxffliu at 2013-05-06 00:18:56
你是说完整蛋白A和非完整蛋白B的复合物，想要把B补全，形成与A的完整复合物么？
如果PDB库中有B的完整结构，把它叠合到AB复合物的B domain就可以了，pymol就能做。如果没有B完整结构的话，只能同源模建一个然后再 ...

啊，我怎么把剩余金币给你呢？没有这个选项了
赞一下 回复此楼
5楼2013-05-06 07:15:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

xxffliu

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
totoro1992: 金币+2, ★★★★★最佳答案, 想再问一个问题 2013-05-05 23:54:34
你需要把配体和受体合并到一个PDB文件里（Combined pdb file），配体和受体分别标记为不同的Chain name，比如A和B，然后Docking partners写成A_B即可。
赞一下 回复此楼
2楼2013-05-05 23:27:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

totoro1992

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xxffliu at 2013-05-05 23:27:09
你需要把配体和受体合并到一个PDB文件里（Combined pdb file），配体和受体分别标记为不同的Chain name，比如A和B，然后Docking partners写成A_B即可。

想再请教个问题 有一个完整蛋白和另一个蛋白domain的复合体结构，想把那个domain恢复成完整蛋白，这个用什么软件啊？
赞一下 回复此楼
3楼2013-05-05 23:58:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xxffliu

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by totoro1992 at 2013-05-05 23:58:43
想再请教个问题 有一个完整蛋白和另一个蛋白domain的复合体结构，想把那个domain恢复成完整蛋白，这个用什么软件啊？...

你是说完整蛋白A和非完整蛋白B的复合物，想要把B补全，形成与A的完整复合物么？
如果PDB库中有B的完整结构，把它叠合到AB复合物的B domain就可以了，pymol就能做。如果没有B完整结构的话，只能同源模建一个然后再叠合了。
赞一下 回复此楼
4楼2013-05-06 00:18:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 342求调剂 +3 加油a李zs 2026-03-26 3/150 2026-03-27 00:29 by wxiongid
[考研] 312求调剂 +8 上岸吧ZJY 2026-03-22 12/600 2026-03-26 18:49 by muchong357
[考研] 352求调剂 +4 大米饭！ 2026-03-22 4/200 2026-03-26 16:40 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿 西北大学 总分282 英语一62 求调剂 +7 18419759900 2026-03-25 7/350 2026-03-26 16:07 by 不吃魚的貓
[考研] 22 350 本科985求调剂，求老登收留 +4 李轶男003 2026-03-20 4/200 2026-03-26 16:05 by 哇啦啦啦xtj
[考研] 303求调剂 +6 蓝山月 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:47 by 418490947
[考研] 一志愿南航 335分 | 0856材料化工 | GPA 4.07 | 有科研经历 +6 cccchenso 2026-03-23 6/300 2026-03-25 22:25 by 544594351
[考研] 299求调剂 +7 某某某某位 2026-03-21 8/400 2026-03-25 20:34 by 热情沙漠
[考研] 311求调剂 +4 勇敢的小吴 2026-03-20 4/200 2026-03-25 18:12 by xcjcqu
[考研] 网络空间安全0839招调剂 +4 w320357296 2026-03-25 6/300 2026-03-25 17:59 by 255671
[考研] 302求调剂 +4 锦衣卫藤椒 2026-03-25 4/200 2026-03-25 16:29 by 功夫疯狂
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +10 纸鱼ly 2026-03-21 11/550 2026-03-24 17:22 by qingfeng258
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-21 6/300 2026-03-24 15:03 by 余意卿
[考研] 一志愿华东理工大学081700，初试分数271 +5 kotoko_ik 2026-03-23 6/300 2026-03-24 10:29 by 学术搬砖er
[基金申请] 请教下大家 2026年国家基金申请是双盲审吗？ +3 lishucheng1 2026-03-22 5/250 2026-03-24 08:22 by gltch
[考研] 276求调剂。有半年电池和半年高分子实习经历 +9 材料学257求调剂 2026-03-23 10/500 2026-03-24 07:36 by wangy0907
[考研] 284求调剂 +3 yanzhixue111 2026-03-23 6/300 2026-03-23 22:58 by pswait
[考研] 接收2026硕士调剂(学硕+专硕) +4 allen-yin 2026-03-23 6/300 2026-03-23 15:04 by 汪！？！
[考研] 285求调剂 +6 ytter 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:09 by 星空星月
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:39 by 学员8dgXkO
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭