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baopeng

木虫 (正式写手)

[求助] 菌株鉴定

分离到一株新的厌氧菌,如何证明它是一个新的属;与现有的最近接的标准菌株对比需要测哪些指标?
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baopeng

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by renzhiq at 2013-05-03 17:16:52
你为什么觉得它就是一个新属呢?要鉴定到是不难,找到保守序列,设计引物,P出来测序比对。如果初步确定是新种,且性能优越,可考虑进一步全基因测序……

16sDNA 与最接近标准菌株相似度为96%。审稿人说可能是新的属,让进一步鉴定,我不知道该比对哪些指标才可以说明是新的属。。。
3楼2013-05-03 21:18:02
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renzhiq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励应助交流! 2013-05-03 20:34:51
你为什么觉得它就是一个新属呢?要鉴定到是不难,找到保守序列,设计引物,P出来测序比对。如果初步确定是新种,且性能优越,可考虑进一步全基因测序……
2楼2013-05-03 17:16:52
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renzhiq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
baopeng: 金币+5, 有帮助, 多谢! 2013-05-04 09:25:26
引用回帖:
3楼: Originally posted by baopeng at 2013-05-03 21:18:02
16sDNA 与最接近标准菌株相似度为96%。审稿人说可能是新的属,让进一步鉴定,我不知道该比对哪些指标才可以说明是新的属。。。...

照你这么说就简单了,直接测序。也不贵,现在测个全基因组也就1万多块钱。最粗暴的办法最能说明问题,测序出来之后,就这个菌株,你们可以出好几篇文章,值得的……

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2013-05-03 23:29:43
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baopeng

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by renzhiq at 2013-05-03 23:29:43
照你这么说就简单了,直接测序。也不贵,现在测个全基因组也就1万多块钱。最粗暴的办法最能说明问题,测序出来之后,就这个菌株,你们可以出好几篇文章,值得的……...

多谢啦
5楼2013-05-04 09:24:54
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