应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 菌株鉴定
111/2返回列表12下一页
查看: 2210  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

baopeng

木虫 (正式写手)

[求助] 菌株鉴定

分离到一株新的厌氧菌，如何证明它是一个新的属；与现有的最近接的标准菌株对比需要测哪些指标？
回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

zrg1989

» 猜你喜欢
1楼 2013-05-03 16:05:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

zrg1989

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
如果你要做的是新种鉴定，简单的方法就是你去找跟你的菌16S序列最相近的那个菌种的鉴定论文（一般在IJSEM），看他做哪些指标，你大概就也做哪些指标，一般包括生理生化特性、脂肪酸图谱、呼吸醌类型、GC含量、极性脂类型、形态等等。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2013-05-04 17:24:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

renzhiq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励应助交流! 2013-05-03 20:34:51
你为什么觉得它就是一个新属呢？要鉴定到是不难，找到保守序列，设计引物，P出来测序比对。如果初步确定是新种，且性能优越，可考虑进一步全基因测序……
赞一下 回复此楼
2楼2013-05-03 17:16:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baopeng

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by renzhiq at 2013-05-03 17:16:52
你为什么觉得它就是一个新属呢？要鉴定到是不难，找到保守序列，设计引物，P出来测序比对。如果初步确定是新种，且性能优越，可考虑进一步全基因测序……

16sDNA 与最接近标准菌株相似度为96%。审稿人说可能是新的属，让进一步鉴定，我不知道该比对哪些指标才可以说明是新的属。。。
赞一下 回复此楼
3楼2013-05-03 21:18:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

renzhiq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
baopeng: 金币+5, ★有帮助, 多谢！ 2013-05-04 09:25:26
引用回帖:
3楼: Originally posted by baopeng at 2013-05-03 21:18:02
16sDNA 与最接近标准菌株相似度为96%。审稿人说可能是新的属，让进一步鉴定，我不知道该比对哪些指标才可以说明是新的属。。。...

照你这么说就简单了，直接测序。也不贵，现在测个全基因组也就1万多块钱。最粗暴的办法最能说明问题，测序出来之后，就这个菌株，你们可以出好几篇文章，值得的……
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

baopeng
4楼2013-05-03 23:29:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baopeng

木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by renzhiq at 2013-05-03 23:29:43
照你这么说就简单了，直接测序。也不贵，现在测个全基因组也就1万多块钱。最粗暴的办法最能说明问题，测序出来之后，就这个菌株，你们可以出好几篇文章，值得的……...

多谢啦
回复此楼
5楼2013-05-04 09:24:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baopeng

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zrg1989 at 2013-05-04 17:24:56
如果你要做的是新种鉴定，简单的方法就是你去找跟你的菌16S序列最相近的那个菌种的鉴定论文（一般在IJSEM），看他做哪些指标，你大概就也做哪些指标，一般包括生理生化特性、脂肪酸图谱、呼吸醌类型、GC含量、极性脂 ...

多谢，有帮助！
回复此楼
7楼2013-05-04 19:40:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

见神一笑

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by baopeng at 2013-05-03 21:18:02
16sDNA 与最接近标准菌株相似度为96%。审稿人说可能是新的属，让进一步鉴定，我不知道该比对哪些指标才可以说明是新的属。。。...

96%的相似性可能是新属？这个审稿人是外行吧，一般到95%以下才有可能是新属了。他是根据什么认定可能是新属的？
赞一下 回复此楼
好好努力
8楼2013-05-05 21:19:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

baopeng

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 见神一笑 at 2013-05-05 21:19:07
96%的相似性可能是新属？这个审稿人是外行吧，一般到95%以下才有可能是新属了。他是根据什么认定可能是新属的？...

相近的标准菌株只有一株，审稿人猜测这两株同属一个新的属。。。
赞一下 回复此楼
9楼2013-05-05 22:32:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

见神一笑

木虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by baopeng at 2013-05-05 22:32:32
相近的标准菌株只有一株，审稿人猜测这两株同属一个新的属。。。...

那就是你误会审稿人的意思了，他说是“同属一个新的属”，那就是这个属已经建立了，你这个只能算是新种了。不过由于是第二个种，需不需要完全按那个标株的方法来做，最好还是找个专家讨论一下。
赞一下 回复此楼
好好努力
10楼2013-05-06 08:28:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 baopeng 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 7/350 2026-11-05 16:08 by My20PsvIExYO
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-05 15:46 by My20PsvIExYO
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 6/300 2026-11-05 15:46 by My20PsvIExYO
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-05 15:36 by My20PsvIExYO
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 10/500 2026-11-05 15:35 by My20PsvIExYO
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 kvewwGtKktqB 2026-11-04 10/500 2026-11-05 15:35 by My20PsvIExYO
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 kvewwGtKktqB 2026-11-04 7/350 2026-11-05 15:35 by My20PsvIExYO
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 12/600 2026-11-05 15:25 by My20PsvIExYO
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 10/500 2026-11-05 15:24 by My20PsvIExYO
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 10/500 2026-11-05 15:24 by My20PsvIExYO
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 13/650 2026-11-05 15:24 by My20PsvIExYO
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 9/450 2026-11-05 15:14 by My20PsvIExYO
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 9/450 2026-11-05 15:13 by My20PsvIExYO
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 18/900 2026-11-05 15:13 by My20PsvIExYO
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 15/750 2026-11-05 15:03 by My20PsvIExYO
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-05 11:10 by PYZmcHr5kSaq
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 8/400 2026-11-05 10:59 by PYZmcHr5kSaq
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-05 10:48 by PYZmcHr5kSaq
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 10/500 2026-11-05 10:39 by PYZmcHr5kSaq
[基金申请] 各位基础老师们，看完中央《从严治党》的决定后，对学术界更加有信心了吧 +5 iaeyuan 2026-11-01 5/250 2026-11-04 14:43 by jinchengzi
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭