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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » LAMMPS温度－步长曲线震荡
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WJ-MS

新虫 (小有名气)

[求助] LAMMPS温度－步长曲线震荡

有几个问题想跟大家请教一下。
1  从网上得到的一个程序（见附件），跑了一下，发现体系的温度一直上升，但是在设定初始温度的时候不是设置的10K么，体系的温度是不是通过 “velocity  all create 1000 87287 dist gaussian“ 这个命令设定阿？随后的温度变化又由什么决定的呢？
2 想计算1000K下的性质，采用“velocity  all create 1000 87287 dist gaussia“， 计算时，先fix npt运算50000步，再fix nvt运算500000步，体系的温度随时间的变化不是应该趋于1000K么，为什么我得到的温度曲线是震荡的呢？
3 此外，RDF曲线，我看别人都是一条曲线，我得到的怎么是很多条曲线的样子？这个该怎么处理呢？具体看附件。
菜鸟级，希望大家多多指教！

温度时间步长.png



rdf.png
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加油！
1楼 2013-04-25 10:46:29
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
WJ-MS: 金币+5, ★★★很有帮助, 多谢指点~~~ 2013-05-07 21:08:56
引用回帖:
7楼: Originally posted by WJ-MS at 2013-05-07 09:20:03
我昨天试了一下，在fix temp/rescale（命令是：fix   1 all temp/rescale 10000 1087.15 1087.15 0.5 1 ）下运行了一百万步，温度就是1087.15K，然后又在nvt（命令：fix  2 all nvt temp 1087.15 1087.15 0.5 drag ...

没有rescale，温度变化很正常。看trajectory， 能量等指标。 数据一直有出处，需要你自己去跟踪分析。
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8楼2013-05-07 11:00:33
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

很多因素会影响温度。 如果内部作用力频繁， 温度波动很正常。 总能量稳定吗？ 你有thernal scale吗？
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

WJ-MS
2楼2013-05-03 13:06:12
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WJ-MS

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-05-03 13:06:12
很多因素会影响温度。 如果内部作用力频繁， 温度波动很正常。 总能量稳定吗？ 你有thernal scale吗？

总能量应该还算稳定，能量时间步长图见附件。
一般要如何操作、多少时间步长才能使温度达到平衡呢？
你所说的thermal scale是哪个命令实现的呀？我看thermal、thermal_modify和thermal_style命令都没有这个功能呀！
多谢指教~~~

能量-时间步长图.jpg
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加油！
3楼2013-05-04 09:11:07
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
WJ-MS: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-05 17:06:43
用Fix temp/rescale。
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4楼2013-05-05 08:15:57
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