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汕头大学海洋科学接受调剂
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WJ-MS

新虫 (小有名气)

[求助] LAMMPS温度-步长曲线震荡

有几个问题想跟大家请教一下。
1  从网上得到的一个程序(见附件),跑了一下,发现体系的温度一直上升,但是在设定初始温度的时候不是设置的10K么,体系的温度是不是通过 “velocity  all create 1000 87287 dist gaussian“ 这个命令设定阿?随后的温度变化又由什么决定的呢?
2 想计算1000K下的性质,采用“velocity  all create 1000 87287 dist gaussia“, 计算时,先fix npt运算50000步,再fix nvt运算500000步,体系的温度随时间的变化不是应该趋于1000K么,为什么我得到的温度曲线是震荡的呢?
3 此外,RDF曲线,我看别人都是一条曲线,我得到的怎么是很多条曲线的样子?这个该怎么处理呢?具体看附件。
菜鸟级,希望大家多多指教!

温度时间步长.png



rdf.png
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加油!
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by WJ-MS at 2013-05-06 20:39:09
我看有的文献里面讲,在npt下运行一定的时间步以达到平衡,然后在nvt系综收集数据,这是什么情况呢?
我用这个命令来控制温度的话,应该在什么情况下收集数据呢?...

不明白你的意思。 数据是否合理,要你自己去试验。
6楼2013-05-07 08:44:12
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

很多因素会影响温度。 如果内部作用力频繁, 温度波动很正常。 总能量稳定吗? 你有thernal scale吗?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2013-05-03 13:06:12
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WJ-MS

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-05-03 13:06:12
很多因素会影响温度。 如果内部作用力频繁, 温度波动很正常。 总能量稳定吗? 你有thernal scale吗?

总能量应该还算稳定,能量时间步长图见附件。
一般要如何操作、多少时间步长才能使温度达到平衡呢?
你所说的thermal scale是哪个命令实现的呀?我看thermal、thermal_modify和thermal_style命令都没有这个功能呀!
多谢指教~~~

能量-时间步长图.jpg

加油!
3楼2013-05-04 09:11:07
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
WJ-MS: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-05 17:06:43
用Fix temp/rescale。
4楼2013-05-05 08:15:57
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