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angel2826

木虫 (正式写手)

[求助] 如何计算分子轨道中原子所占的成分？？

在http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1058437链接中看帖子“怎么知道分子轨道中各原子的成分以及比重呢”中，三楼lixiaona158的回复“把你要计算的轨道中某部分的原子所有轨道平方加和，在把这个轨道中所有原子的平方加和，在用之前那部分的和除以总和就是这部分在这个轨道中所占比例” 是不是这个意思,例如:
                        78        79        80        81        82
                           O         O         O         O         O
     Eigenvalues --    -0.28940  -0.28336  -0.25548  -0.25028  -0.22351
   1 1   C  1S         -0.00034   0.00063   0.00027   0.00008   0.00005
   2        2S         -0.00085   0.00115   0.00055   0.00019   0.00004
   3        2PX         0.02407  -0.00897  -0.00628  -0.00542  -0.00114
   4        2PY        -0.03660   0.01432   0.00675   0.00876   0.00639
   5        2PZ         0.00416  -0.00057   0.01552  -0.05118  -0.08474
   6        3S          0.00409  -0.00434  -0.00229  -0.00091   0.00025
   7        3PX         0.04006  -0.01467  -0.01097  -0.00931  -0.00189
   8        3PY        -0.04866   0.01972   0.00689   0.01211   0.01183
   9        3PZ         0.00786  -0.00137   0.02614  -0.08520  -0.13931
  10        4S         -0.01601   0.02082   0.00890   0.00943  -0.01185
  11        4PX         0.01879  -0.01991  -0.00305  -0.01236   0.02025
  12        4PY         0.05506  -0.03244  -0.01656  -0.00921   0.01949
  13        4PZ         0.01240  -0.00454   0.01308  -0.06284  -0.12151
  14        5S         -1.14793  -0.14371   0.37927  -0.09726   0.00651
  15        5PX        -0.48572   0.18045   0.44378   0.31527  -0.40411
  16        5PY         0.49733  -0.09583  -0.38480  -0.23753   0.32573
  17        5PZ         0.06130  -0.00965  -0.10538   0.03894  -0.00781"
要计算对轨道82，1号C的原子的成分,对该原子所有轨道平方加和就是:
0.00005^2+0.00004^2+（-0.00114）^2.......+( -0.00781)^2
再除以以同样的方法计算轨道82，其它所有原子的，再加和

问题是有些轨道是负数，这样也可以吗，如2PX    为-0.00114
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1楼2013-04-24 07:09:48
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maynard

金虫 (初入文坛)
如果只是想得到分子轨道中原子占的成分，用Pop=Orbital 就行了，具体用法可以参考g09帮助
http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/k_population.htm

如果想计算分子片段所占的成分还是借用其它软件比较好，如Multiwfn，ADF

想认真研究下轨道组成的理论还能参考下sobereva大大的几篇文章
http://hi.baidu.com/sobereva/item/d52876160110ca8d89a956c5
http://hi.baidu.com/sobereva/item/dbc9ae773c949f44ee1e53d7
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7楼2013-04-25 09:25:26
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wolfzhong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+2 2013-04-24 20:21:01
angel2826: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 原来看看过一些这么算的，就是不理解负数的也能平方相加，现在明白了，谢谢哦 2013-04-25 06:29:01
就是你说的方法，82轨道的所有轨道系数平方和就是你说的总和。但是这个和求出来不是1，因为不同的原子轨道之间是不正交的。
符号是负的表示原子轨道堆积时是反向的，或者说相位相反。没问题的。
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2楼2013-04-24 13:20:56
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aixiaok110

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wolfzhong at 2013-04-24 13:20:56
就是你说的方法，82轨道的所有轨道系数平方和就是你说的总和。但是这个和求出来不是1，因为不同的原子轨道之间是不正交的。
符号是负的表示原子轨道堆积时是反向的，或者说相位相反。没问题的。

哦，这啊，那非常感谢你了！
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3楼2013-04-24 20:49:26
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aixiaok110

木虫 (著名写手)
我也最近在苦于这个怎么算呢，那还有那什么前线轨道电子密度的不知道这么算的
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4楼2013-04-24 20:52:26
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