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如何计算分子轨道中原子所占的成分？？
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在http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1058437链接中看帖子“怎么知道分子轨道中各原子的成分以及比重呢”中，三楼lixiaona158的回复“把你要计算的轨道中某部分的原子所有轨道平方加和，在把这个轨道中所有原子的平方加和，在用之前那部分的和除以总和就是这部分在这个轨道中所占比例” 是不是这个意思,例如: 78 79 80 81 82 O O O O O Eigenvalues -- -0.28940 -0.28336 -0.25548 -0.25028 -0.22351 1 1 C 1S -0.00034 0.00063 0.00027 0.00008 0.00005 2 2S -0.00085 0.00115 0.00055 0.00019 0.00004 3 2PX 0.02407 -0.00897 -0.00628 -0.00542 -0.00114 4 2PY -0.03660 0.01432 0.00675 0.00876 0.00639 5 2PZ 0.00416 -0.00057 0.01552 -0.05118 -0.08474 6 3S 0.00409 -0.00434 -0.00229 -0.00091 0.00025 7 3PX 0.04006 -0.01467 -0.01097 -0.00931 -0.00189 8 3PY -0.04866 0.01972 0.00689 0.01211 0.01183 9 3PZ 0.00786 -0.00137 0.02614 -0.08520 -0.13931 10 4S -0.01601 0.02082 0.00890 0.00943 -0.01185 11 4PX 0.01879 -0.01991 -0.00305 -0.01236 0.02025 12 4PY 0.05506 -0.03244 -0.01656 -0.00921 0.01949 13 4PZ 0.01240 -0.00454 0.01308 -0.06284 -0.12151 14 5S -1.14793 -0.14371 0.37927 -0.09726 0.00651 15 5PX -0.48572 0.18045 0.44378 0.31527 -0.40411 16 5PY 0.49733 -0.09583 -0.38480 -0.23753 0.32573 17 5PZ 0.06130 -0.00965 -0.10538 0.03894 -0.00781" 要计算对轨道82，1号C的原子的成分,对该原子所有轨道平方加和就是: 0.00005^2+0.00004^2+（-0.00114）^2.......+( -0.00781)^2 再除以以同样的方法计算轨道82，其它所有原子的，再加和 问题是有些轨道是负数，这样也可以吗，如2PX 为-0.00114 |
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如果只是想得到分子轨道中原子占的成分，用Pop=Orbital 就行了，具体用法可以参考g09帮助 http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/k_population.htm 如果想计算分子片段所占的成分还是借用其它软件比较好，如Multiwfn，ADF 想认真研究下轨道组成的理论还能参考下sobereva大大的几篇文章 http://hi.baidu.com/sobereva/item/d52876160110ca8d89a956c5 http://hi.baidu.com/sobereva/item/dbc9ae773c949f44ee1e53d7 |
7楼2013-04-25 09:25:26
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