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angel2826

木虫 (正式写手)

[求助] 如何计算分子轨道中原子所占的成分??

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1058437链接中看帖子“怎么知道分子轨道中各原子的成分以及比重呢”中,三楼lixiaona158的回复“把你要计算的轨道中某部分的原子所有轨道平方加和,在把这个轨道中所有原子的平方加和,在用之前那部分的和除以总和就是这部分在这个轨道中所占比例” 是不是这个意思,例如:
                        78        79        80        81        82
                           O         O         O         O         O
     Eigenvalues --    -0.28940  -0.28336  -0.25548  -0.25028  -0.22351
   1 1   C  1S         -0.00034   0.00063   0.00027   0.00008   0.00005
   2        2S         -0.00085   0.00115   0.00055   0.00019   0.00004
   3        2PX         0.02407  -0.00897  -0.00628  -0.00542  -0.00114
   4        2PY        -0.03660   0.01432   0.00675   0.00876   0.00639
   5        2PZ         0.00416  -0.00057   0.01552  -0.05118  -0.08474
   6        3S          0.00409  -0.00434  -0.00229  -0.00091   0.00025
   7        3PX         0.04006  -0.01467  -0.01097  -0.00931  -0.00189
   8        3PY        -0.04866   0.01972   0.00689   0.01211   0.01183
   9        3PZ         0.00786  -0.00137   0.02614  -0.08520  -0.13931
  10        4S         -0.01601   0.02082   0.00890   0.00943  -0.01185
  11        4PX         0.01879  -0.01991  -0.00305  -0.01236   0.02025
  12        4PY         0.05506  -0.03244  -0.01656  -0.00921   0.01949
  13        4PZ         0.01240  -0.00454   0.01308  -0.06284  -0.12151
  14        5S         -1.14793  -0.14371   0.37927  -0.09726   0.00651
  15        5PX        -0.48572   0.18045   0.44378   0.31527  -0.40411
  16        5PY         0.49733  -0.09583  -0.38480  -0.23753   0.32573
  17        5PZ         0.06130  -0.00965  -0.10538   0.03894  -0.00781"
要计算对轨道82,1号C的原子的成分,对该原子所有轨道平方加和就是:
0.00005^2+0.00004^2+(-0.00114)^2.......+( -0.00781)^2
再除以以同样的方法计算轨道82,其它所有原子的,再加和

问题是有些轨道是负数,这样也可以吗,如2PX    为-0.00114
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wolfzhong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+2 2013-04-24 20:21:01
angel2826: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 原来看看过一些这么算的,就是不理解负数的也能平方相加,现在明白了,谢谢哦 2013-04-25 06:29:01
就是你说的方法,82轨道的所有轨道系数平方和就是你说的总和。但是这个和求出来不是1,因为不同的原子轨道之间是不正交的。
符号是负的表示原子轨道堆积时是反向的,或者说相位相反。没问题的。
2楼2013-04-24 13:20:56
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aixiaok110

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wolfzhong at 2013-04-24 13:20:56
就是你说的方法,82轨道的所有轨道系数平方和就是你说的总和。但是这个和求出来不是1,因为不同的原子轨道之间是不正交的。
符号是负的表示原子轨道堆积时是反向的,或者说相位相反。没问题的。

哦,这啊,那非常感谢你了!
3楼2013-04-24 20:49:26
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aixiaok110

木虫 (著名写手)

我也最近在苦于这个怎么算呢,那还有那什么前线轨道电子密度的不知道这么算的
4楼2013-04-24 20:52:26
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angel2826

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wolfzhong at 2013-04-24 13:20:56
就是你说的方法,82轨道的所有轨道系数平方和就是你说的总和。但是这个和求出来不是1,因为不同的原子轨道之间是不正交的。
符号是负的表示原子轨道堆积时是反向的,或者说相位相反。没问题的。

原来看看过一些这么算的,就是不理解负数的也能平方相加,现在明白了,谢谢哦
5楼2013-04-25 06:29:36
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angel2826

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wolfzhong at 2013-04-24 13:20:56
就是你说的方法,82轨道的所有轨道系数平方和就是你说的总和。但是这个和求出来不是1,因为不同的原子轨道之间是不正交的。
符号是负的表示原子轨道堆积时是反向的,或者说相位相反。没问题的。

还有假如我想算分子前线轨道中某个基团或者分子片段所占的成分是不是也是这算法?
6楼2013-04-25 06:33:41
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maynard

金虫 (初入文坛)

如果只是想得到分子轨道中原子占的成分,用Pop=Orbital 就行了,具体用法可以参考g09帮助
http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/k_population.htm

如果想计算分子片段所占的成分还是借用其它软件比较好,如Multiwfn,ADF

想认真研究下轨道组成的理论还能参考下sobereva大大的几篇文章
http://hi.baidu.com/sobereva/item/d52876160110ca8d89a956c5
http://hi.baidu.com/sobereva/item/dbc9ae773c949f44ee1e53d7
7楼2013-04-25 09:25:26
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